Hea bonsai väetis ei pea olema spetsiaalne puuväetis ja võib kasutada sama taimset toitu nagu teised taimed. Parim väetis bonsaipuude jaoks peaks aga olema tasakaalus kolme peamise toitaine vahel. Lisaks ei tohiks te kasutada liiga rikkalikku bonsai väetist. Kasvuperioodil sobivad kõige paremini leheväetised, mis on lehestikule pritsitavad vedelad aiaväetised, ja lahustuvad mullaväetised. Igihaljaste taimede puhul on talvel kõige parem kasutada aeglaselt vabanevaid graanuleid.
Kõik puud ja taimed, sealhulgas bonsai puud, vajavad samu toitaineid: lämmastikku, fosfaate ja kaaliumkloriidi. Lämmastik soodustab tugevaid varsi ja terveid lehti. Fosfaadid toidavad ja tugevdavad juuri. Potas suurendab vastupanuvõimet seenhaigustele ja annab taimele vastupidavuse karmidele kliimatingimustele. Kõik taimse toidu või väetiste etiketid viitavad nendele kolmele toitainele selles järjekorras: lämmastik (N), seejärel kaalium (P), seejärel kaaliumkloriid (K).
Bonsai puud vajavad neidsamu kolme toitainet, aga ka väikseid mikroelemente nagu molübdeen, magneesium, tsink ja boor. Enamikul väetistel on need mikroelemendid ja kolm põhielementi. Üldkasutatavas bonsai väetises tuleb kolm peamist elementi tasakaalustada. Sügisel tuleks aga kasutada laialehistele liikidele mõeldud lämmastikuvaba väetist, et kõik võrsed enne talve kivistuks. Igihaljad puud seevastu vajavad talveks vähetugevat ja aeglaselt eralduvat väetist, kuna need jäävad külmadel kuudel veidi aktiivseks.
Väetise etiketid sisaldavad tähti “NPK”, mis viitavad kolmele põhitoitainele, millele järgneb kolm numbrit, mis näitavad iga kolme toitaine massiprotsenti. Parima bonsai väetise NPK reiting on “7:8:8”. See on kõigi toitainete tasakaal ja see ei ole liiga tugev ega liiga rikkalik. Kõrgemad NPK-reitingud, nagu „20:15:15”, on liiga rikkalikud ja põhjustavad bonsaipuu juurte põlemist. Ärge kasutage toataimede väetisi, sest peaaegu kõik need on liiga rikkad.
Bonsai puu vajab väetamist poole väetise või taimse toidu etiketil märgitud kangusega. Teisest küljest peaks väetamine toimuma kaks korda sagedamini, kui silt ette näeb. Ärge toitke bonsaid üle. Ärge väetage bonsai puud talvekuudel. Järgides neid lihtsaid reegleid bonsai väetise kasutamisel, saate hästi toidetud bonsai puu.