Neonatoloogia stipendiumi saamine nõuab aastatepikkust õppimist ja koolitust. Stipendiumiprogramm on neonatoloogi koolituse viimane osa, mille käigus arst hoolitseb patsientide eest, olles samas kogenud neonatoloogi järelevalve all. Enne neonatoloogia stipendiumi taotlemist on vajalik, et inimene käiks pikki aastaid koolis. Pärast meditsiinikooli lõpetamist ja pediaatria residentuuri läbimist võib arst taotleda neonatoloogia stipendiumi.
Ameerika Ühendriikides ja Kanadas kulub neonatoloogia stipendiumi saamiseks õpilasel tavaliselt üksteist aastat. Enne stipendiumi taotlemist peab arst olema läbinud neli aastat bakalaureuse- või eelõpinguid, neli aastat meditsiinikooli ja kolm aastat pediaatrilist residentuuri. Teiste riikide arstid, kes soovivad taotleda stipendiumi Ameerika Ühendriikides või Kanadas, peavad enne kandideerimist tõendama, et neil on samaväärne haridus.
Neonatoloogia stipendiumi saamiseks peab arstil olema tugev akadeemiline rekord ja ta peab olema läbinud mitu arstliku nõukogu eksamit. Esimene uuringute komplekt tehakse arstiteaduskonna lõpus või arsti residentuuri alguses ja annab arstile tegevusloa arstiga tegelemiseks. Enne neonatoloogia stipendiumi taotlemist peab arst läbima mitmeid eksameid, mis tõendavad tema pädevust pediaatrilises meditsiinis.
Kui arst on saanud pediaatrilise meditsiini tunnistuse või kui arst on valmis saama sertifikaadi enne stipendiumiprogrammi algust, on võimalik alustada neonatoloogia stipendiumi taotlemise protsessi. Nendesse programmidesse vastuvõtmine on väga konkurentsitihe ja neonatoloogia stipendiumi taotleb rohkem arste, kui neile pakutakse. Paljud arstid otsustavad kandideerida mitmesse programmi, et suurendada oma võimalusi ühte programmi vastu võtta.
Taotlusnõuded on programmiti erinevad, mistõttu on oluline, et arst vaataks hoolikalt läbi iga programmi nõuded, et saaks esitada kõik nõutavad materjalid. Enamik programme nõuab arsti ärakirjade, meditsiinikomisjoni eksamitulemuste, CV ja mitmete soovituskirjade koopiat. Kui arst lõpetas osa oma haridusteest mõnes muus riigis peale Ameerika Ühendriikide, võidakse nõuda samaväärsuseksameid või aruandeid. Huvitatud ülikool või haigla võtab seejärel tulevase stipendiaadiga ühendust, et korraldada intervjuu.