Biokeemia ühendab bioloogia ja keemia uuringud, et uurida organismide rakutasandi metaboolseid radu. Lisaks sellele, et biokeemia kasutatakse taimede ja mikroorganismide metaboolsete radade uurimisel, on see eksperimentaalne teadus, mis sõltub suuresti selle distsipliini jaoks ainulaadsete instrumentide olemasolust. See on lai teema, kuid on mõned põhimõisted, mida käsitletakse igal alustaval biokeemia kursusel.
1
Jäta meelde aminohapete struktuur. Aminohapped on kõigi valkude ehitusplokid. Kõigi 20 aminohappe struktuuri ja omaduste meeldejätmine on biokeemia oluline aspekt. Teadke nende ühe- ja kolmetähelisi lühendeid, et need õppimise ajal kiiresti ära tunda. Mälukaartide koostamine on suurepärane viis aminohapete struktuuride meeldejätmiseks.Õppige aminohappeid 5 rühmas 4.Jätke meelde olulised omadused, nagu happelised (negatiivselt laetud) versus aluselised (positiivselt laetud) ja polaarsed versus hüdrofoobsed omadused.Joonistage nende struktuurid ja läbi, kuni olete need mällu pühendanud. Õnneks on aminohapetel sarnane struktuur. Igaüks neist sisaldab aluselist aminorühma (−NH2), happelist karboksüülrühma (−COOH) ja vesinikrühma (-H). Neid eristab orgaaniline R-rühm (või kõrvalahel), mis määrab nende funktsiooni ja on iga aminohappe jaoks ainulaadne.
2
Tuvastage valkude struktuure. Valgud koosnevad aminohapete ahelatest. Valgustruktuuride erinevate tasemete äratundmine ja oluliste (alfa-heeliksid ja beeta-lehed) joonistamine on biokeemia põhimõisted. Valgu struktuuril on neli taset: Esmane struktuur on aminohapete lineaarne paigutus. Neid hoiavad koos polüpeptiidahelas peptiidsidemed. Sekundaarne struktuur moodustab valkude osad, mis voldivad alfa-heeliksiks ja beeta-lehtedeks, mida juhib vesinikside.Tertsiaarstruktuur on kolmemõõtmeline struktuur, mis tuleneb aminorühmade vastastikmõjudest. happed, mida tavaliselt juhivad disulfiidsidemed, vesiniksidemed ja hüdrofoobsed vastasmõjud. See on valgu füsioloogiline kuju. Paljude valkude tertsiaarne struktuur on siiani teadmata. Kvaternaarne struktuur tuleneb mitme eraldiseisva valgu koosmõjul, moodustades ühe suurema üksiku valgu. Need sisaldavad sageli subühikuid ja on kerakujulised.
3
Mõistke pH skaalat. Lahuse pH on happesuse mõõt. See on seotud lahuses olevate vesiniku- ja hüdroksiidioonide hulgaga. Happelises lahuses on lahuses rohkem vesinikioone ja vähem hüdroksiidiioone. Aluseliste lahuste puhul on vastupidi: rohkem hüdroksiidiioone, vähem vesinikioone.Happed on vesinikioonide (H+) doonorid ja nende pH on < 7.Alused on vesinikioonide (H+) aktseptorid ja nende pH on > 7.
4
Määratlege lahuse pKa. Lahuse Ka kasutatakse selleks, et ennustada happe dissotsiatsiooni ulatust või seda, kui kiiresti hape loobub oma vesinikuioonidest. See on defineeritud võrrandiga Ka = [H+][A-]/[HA]. Enamiku lahenduste Ka võib asuda teie õpiku tabelis või veebis. pKa on defineeritud kui Ka negatiivne log. Tugevad happed dissotsieeruvad täielikult ja neil on väga väike pKa. Nõrgad happed dissotsieeruvad mittetäielikult ja neil on kõrgem pKa.
5
Seostage pH ja pKa, kasutades Hendersoni-Hasselbalchi võrrandit. Hendersoni-Hasselbalchi võrrandit kasutatakse lahuste puhvrite valmistamiseks laboris. Seda kasutatakse ka happe-aluse reaktsioonides pH tasakaalu leidmiseks. Võrrandis on kirjas, et pH = pKa + log [alus]/[hape]. Lahuse pKa on võrdne lahuse pH-ga, kui happe ja aluse kontsentratsioonid on samad. Puhver on lahus, mis peab vastu pH muutustele, kui sellele lisatakse väikeses koguses happelisi või aluselisi lahuseid. Need on olulised lahuste stabiilse pH hoidmiseks. Puhvrid on olulised ka bioloogilistes süsteemides, näiteks inimkeha pH 7,4 juures hoidmisel.
6
Tunne ära ioonsed ja kovalentsed sidemed. Aatomite vahel tekib ioonside, kui ühelt aatomilt eemaldatakse üks või mitu elektroni ja annetatakse teisele aatomile. Saadud positiivsed ja negatiivselt laetud ioonid tõmbavad seejärel üksteist. Kovalentsed sidemed tekivad siis, kui kaks aatomit jagavad elektronpaare. Olulised on ka muud jõud, nagu vesiniksidemed (atraktiivsed jõud vesinikuaatomite ja väga elektronegatiivsete molekulide vahel). Aatomite vahel moodustuva sideme tüüp määrab ära mõned molekuli omadused.
7
Lugege ensüümide kohta. Ensüümid on organismis oluline valkude klass, mida kasutatakse biokeemiliste reaktsioonide katalüüsimiseks (kiiruse suurendamiseks), vähendades aktiveerimisenergiat. Peaaegu iga biokeemiline reaktsioon kehas on katalüüsitud teatud tüüpi ensüümi poolt; seetõttu on ensümaatilise funktsiooni mehhanismi uurimine biokeemia põhiteema. Seda uuritakse peamiselt kineetilisest vaatepunktist. Ensüümide inhibeerimist kasutatakse farmakoloogiliselt mitmesuguste organismi mõjutavate haiguste raviks. Ensüümid ei muutu ega harju reaktsioonides ära, seega võivad nad läbi viia mitmeid katalüüsi ringe.
8
Lugege ja uurige raja kujundeid. On mitmeid olulisi metaboolseid teid, mida peate biokeemia analüüsimisel meelde jätma: glükolüüs, oksüdatiivne fosforüülimine, sidrunhappe tsükkel (Krebsi tsükkel), elektronide transpordiahel ja fotosüntees. Lugege vastavat teksti oma omast broneerige ja uurige joonist, mis kirjeldab raja protsessi üksikasjalikult. On tõenäoline, et peate suutma joonistada testiga kogu tsükli.
9
Õppige üks tee korraga. Kui proovite uurida kõiki teid korraga, ajate need segadusse ja teil pole ühegi jaoks tugevat alust. Keskenduge ühe tee õppimisele ja vaadake see tee paar päeva üle, enne kui asute järgmisele. Kui olete ühe õppinud, ärge laske sellel kaduda. Joonistage see sageli ümber, et hoida seda värskena. Tehke veebiviktoriine või paluge mõnel sõbral end testida, et ainevahetusrajad teie meelest värskena püsiksid.
10
Joonistage põhitee. Kui alustate esimest korda õppimist, alustage põhirajast. Mõned rajad on tsükkel, mis jätkub (sidrunhappe tsükkel), samas kui teised rajad on lineaarne protsess (glükolüüs). Alustage õppimist, jättes meelde raja kuju, kust rada algab, mis laguneb ja mis sünteesitakse. Iga tsükli jaoks on teil lähtemolekulid, nagu NADH, ADP või glükoos, ning lõpptooted, nagu ATP ja glükogeen. Jäta need üldised tükid kõigepealt meelde.
11
Lisage kofaktorid ja metaboliidid. Nüüd olge teega täpsem. Metaboliidid on vahepealsed molekulid, mis moodustuvad protsessi käigus, kuid harjuvad reaktsiooni jätkudes ära. On ka kofaktoreid, mis on vajalikud reaktsiooni kiiruseks või aitavad seda kiirendada. Vältige meeldejätmist meeldejätmise huvides. Õppige, kuidas iga vaheaine muutub järgmiseks, et saaksite protsessist reaalselt aru, selle asemel et lihtsalt meelde jätta.
12
Tõmmake sisse vajalikud ensüümid. Raja meeldejätmise viimane samm on reaktsiooni läbiviimiseks vajalike ensüümide lisamine. Selliste osade kaupa tee õppimine muudab selle alustamise vähem üle jõu käivaks. Kui olete kõik ensüümide nimed selgeks õppinud, on kogu rada lõppenud. Nüüd peaksite saama hõlpsasti välja kirjutada kõik ainevahetusrajas osalevad valgud, metaboliidid ja molekulid. Veenduge, et teate, millised protsessi etapid on pöördumatu ja miks (vajadusel).
13
Vaadake teid sageli üle. Seda tüüpi teavet tuleb igal nädalal üle vaadata ja uuesti joonistada, vastasel juhul unustate selle. Võtke iga päev aega erinevate radade ülevaatamiseks ja veenduge, et teate, kus kehas see toimub. Nädala lõpuks olete need kõik üle vaadanud ja siis võite alustada järgmisest nädalast. Kui testiaeg saabub, ei pea te muretsema kõigi ainevahetusradade õppimise pärast, sest teil on need juba olemas pähe jäetud.
14
Lugege õpikut. Iga õpitava kursuse õpiku lugemine on aine õppimiseks hädavajalik. Enne tundi lugege läbi ja vaadake materjal, mida sel päeval käsitletakse. Tehke loetu kohta märkmeid ja olete tunniks paremini ette valmistatud. Lugege kindlasti mõistmiseks. Iga jaotise lõpus tehke oma märkmete materjalist kokkuvõte. Proovige vastata mõnele peatüki lõpus olevale küsimusele, et kontrollida, kuidas mõistate mõisteid.
15
Uurige õpiku kujundeid. Teie õpiku joonised on väga üksikasjalikud ja aitavad visualiseerida, mida tekst teile räägib. Sageli on mõistest palju lihtsam aru saada, vaadates sellest pilti, kui lihtsalt sõnu lugedes. Joonistage oma märkmetesse olulised arvud ümber, et hiljem tagasi minna ja uurida.
16
Värvige oma märkmed värviga. Biokeemias on palju keerulisi protsesse. Töötage välja ja kasutage oma märkmete jaoks värvikoodide süsteemi. Võib-olla kirjutage oma märkmed raskuste põhjal nii, et üks värv esindab tõeliselt keerulisi mõisteid ja teine värv – mõisted, mida kergesti mäletate ja mõistate. Kasutage teie jaoks sobivat süsteemi. Ärge lihtsalt kopeerige oma sõbra märkmeid ja lootke, et see aitab teil õppida paremini. Vältige üle pingutamist. Liiga paljude erinevate värvide kasutamine muudab teie märkmed vikerkaareks, kuid see pole nii kasulik.
17
Esitada küsimusi. Õpiku lugemise ajal kirjutage üles küsimused väidete või mõistete kohta, mis tekitavad segadust. Esitage küsimusi ka loengu ajal. Ärge kartke kätt tõsta. Kui teil on küsimus, on tõenäoline, et teistel klassiliikmetel on sama küsimus. Pöörduge oma õpetaja poole, et esitada küsimusi, millele ei pruugi tunni ajal vastata.
18
Tehke mälukaarte. Biokeemiaga on seotud palju sõnavarasõnu, mida te võib-olla pole varem näinud, ja paljud sõnad on sarnased. Nende sõnade ja nendevaheliste erinevuste õppimine alguses aitab teil mõista hiljem sellel sõnavaral põhinevaid mõisteid.Kirjutage välja pabermälukaarte või tehke digitaalseid mälukaarte, mida saate telefonis kaasas kanda.Kui teil on seisakuid, võtke välja mälukaarte ja sirvige neid.