Kui jooksja teeb otsuse, et ta soovib läbida 26.2 miilise (42.2 km) jooksu, mida nimetatakse maratoniks, on see vaid jäämäe tipp. Järgmiseks peab jooksja paika panema oma maratonitreeningu ajakava. Seda tehes peab ta otsustama, kas ta treenib algaja jooksjana, püüdes vaid võistlust lõpetada; vahepealseks, püüdes oma aega parandada; või asjatundliku jooksjana – püüdes saavutada kõrget ajaeesmärki või isegi rahalist auhinda. Kuigi maratoni treeningute ajakava on tavaliselt umbes 18 nädalat pikk, on sageli soovitatav alustada vähemalt 20 nädalat tegelikust võistlusest eemal, sest vigastused võivad juhtuda ja võivad treenimist segada.
Algajad või need, kellel pole iga päev tunde treenimiseks, jooksevad tavaliselt neli päeva nädalas kogu 18-nädalase maratonitreeningu ajakava jooksul. Igal nädalal on ka risttreeningu ja puhkepäevad. Algajate maratonijooksjate võti on lisada maratoni treeningute ajakavasse kilomeetreid järk-järgult ja teha iga nädal üks pikem jooks. Risttreeningud võivad hõlmata ujumist, jalgrattasõitu ja elliptilist masinat.
Algajate maratonijooksjate jaoks võib maratonitreeningu ajakava näide välja näha selline: esimesel treeningnädalal peaksid jooksjad jooksma esimesel kolmel päeval 3 miili (4.8 km) ja seejärel jooksma 6 miili (9.7 km) pika jooksu sel nädalal. Kaks päeva nädalas peaksid olema puhkepäevad ja üks päev nädalas tuleks kasutada risttreeninguteks. Pikaajaline periood muutub iga nädalaga järk-järgult pikemaks. Umbes 15. nädalaks saavutab pika jooksu haripunkt 20 miili (32.1 km). Maratonitreeningu ajakava viimastel nädalatel jookseb jooksja vähem miile, et säästa oma jõupingutusi võistluse jaoks ja vältida ületreeningut.
Keskastme jooksja kasutab oma maratoni treeningu ajakavas veidi teistsugust vormingut. Veidi keerulisem ja aeganõudvam kesktaseme ajakava algab esimesel nädalal 3 miili (4.8 km) jooksuga, 5 miili (8 km) jooksuga, veel 3 miili (4.8 km) jooksuga, 5 miili (8 km) jooksuga. ) tempojooks ja seejärel 10 miili (16 km) pikkune jooks. Üheteistkümnendaks nädalaks jookseb jooksja oma 20 miili (32.1 km) pika jooksu, seega jõuab ta seda uuesti teha kolmeteistkümnendal ja viieteistkümnendal nädalal. Lisaks on nädala sees lühemad jooksud tavaliselt pikemad kui algaja graafiku ajal. Kesktaseme jooksjad jätkavad igal nädalal ühel päeval ujumist või muud tegevust; kuid puhkepäevad on piiratud ühe korraga nädalas.
Asjatundlik maratonitreeningu ajakava, kilomeetrid on pikemad ja suurem tähelepanu pööratakse jooksja aja parandamisele. Kaasatud on ka kiirustreeningud, mis hõlmavad mäkke kordusi, tempojooksusid ja intervalltreeninguid; aga neile, kes tööga alustasid – maraton ei ole sobiv aeg sellega seotud oskuste omandamiseks. Üks päev nädalas tuleks siiski reserveerida keha puhkamiseks; risttreeningut aga enam ei kuulu.
Järgides jooksja oskuste tasemele vastavat maratoni treeningkava, on võimalik see läbida. Enne sellises pingelises igapäevases treeningus osalemist on oluline lasta end arsti juures kontrollida.