Kuigi faili prügikasti panemine ja seejärel kustutamine võib olla hea viis failist vabanemiseks, on tõsi, et fail on endiselt alles. Arvamus, et fail on täielikult kadunud, on levinud eksiarvamus, kuid arukamad arvutikasutajad saavad aru, et faili kustutamine ei tee tegelikult midagi sarnast. See lihtsalt peidab faili arvutist. Neile, kes peavad seda häirivaks, on mitu võimalust kustutatud failide põhjalikumaks kustutamiseks.
Üks lihtsamaid viise kustutatud failide kustutamiseks on kõvaketta vormindamine. Tavaliselt pühib see süsteemi täielikult puhtaks ja isegi programmid, mida tavaliselt kasutatakse kustutatud failide taastamiseks, ei leia neid üles. See on üks drastilisemaid viise failidest vabanemiseks, kuid tavaliselt see toimib.
Teine võimalus kustutatud failide kustutamiseks on andmete kustutusprogrammi kasutamine. Andmekustutuskumme on kahte tüüpi. Mõnda kasutatakse üksikute failide jaoks. Teisi kasutatakse kogu kõvaketta jaoks. Valitud valik on üldiselt kasutaja otsustada, kuid mitte kõik tarkvaratooted ei tee mõlemat. Kasutajad peaksid enne ostmist mõistma, mis on tarkvaratoodete erinevus. Vastasel juhul on suur tõenäosus, et tarbija võib tootes pettuda.
Täielikku andmete kustutamist teostav tarkvara on kõvaketta vormindamisega väga sarnane. See kustutab täielikult kustutatud failid ja kõik muud arvutis olevad failid. Need, kes seda suvandit kasutavad, peaksid sellele väga tähelepanu pöörama ja veenduma, et kõik olulised failid oleksid varukoopiad. See on ainus viis pärast tarkvara töö lõpetamist kõik soovitud täielikult taastada.
Muud tüüpi kustutatud failide kustutamiseks kasutatavat tarkvara saab kasutada ainult üksikute failide jaoks. See on tõenäoliselt olukord, mida enamik arvutikasutajaid eelistab. See hoiab kõik muud failid masinas ja säästate kasutajat aeganõudvast protsessist, milleks on kõigi soovitud tarkvaratoodete arvutisse uuesti installimine. Seda tüüpi tarkvara nimetatakse mõnikord andmepurustajaks ja põhimõtteliselt kirjutab see faili mitu korda juhuslike andmetega üle. Mida rohkem kordi faili üle kirjutatakse, seda raskem on algset teavet hankida.
Neile, kes tunnevad erilist muret tundliku teabe pärast, tuleb märkida, et kustutatud failide kustutamiseks kasutatavat meetodit ei saa tõesti garanteerida. Alati võib olla võimalus, et mõned andmed jäävad kõvakettale taastatavale kujule, eriti kuna tehnoloogia muutub alati võrrandi mõlemal poolel. Lisaks kõvaketta füüsilisele hävitamisele ja uue riistvara installimisele saab midagi siiski taastada, kui ülesandele piisavalt vaeva näha ja aega. Kuid enamikul juhtudel teevad andmete purustamise programmid soovimatutest failidest vabanemiseks piisavat tööd, välja arvatud juhul, kui seda otsiv isik on väga hästi koolitatud.