Käte desinfitseerimisvahend töötab kõrge alkoholisisalduse tõttu. Kuid see ei sobi igat tüüpi mustuse või pinnase puhastamiseks. See, kuidas seda rakendatakse, võib mõjutada ka selle eeliseid.
Alkohol tapab enamiku baktereid ja kätepuhastusvahend sisaldab suures koguses alkoholi. Kui seda kätele umbes 30 sekundit hõõruda, eemaldab see tõesti paljud bakterite vormid ja ka paljud viirused. See on osutunud väga tõhusaks mõne ohtliku bakterivormi vastu, nagu metitsilliiniresistentne Staphylococcus aureus (MRSA), mis võib põhjustada surmavaid ja hirmutavaid lihasööjaid baktereid.
Isik, kes kasutab kätepuhastusvahendit, näitab tõenäoliselt ka aeglasemat bakterite taastumist. Kõigil inimestel on kogu aeg kätes mingid bakterid. Kätepuhastusvahend kipub pärast asjakohast kasutamist aeglustama bakterite kasvu kätel. See ei pruugi olla kõigi mikroobide ennetamisel võrdselt tõhus, kuna mõned viirused levivad nakatunud inimeste ninatilkade sissehingamise kaudu, nagu külmetushaiguse puhul. Kuid desinfitseerimisvahendite kasutamine koolides on seotud haigestumiste arvu vähenemise ja paremate külastatavusega.
Teine põhjus, miks kätepuhastusvahend võib mõnel juhul kätepesust tõhusam olla, on see, et seda on lihtsam ja kiirem kasutada. Tõeliselt tõhus kätepesu nõuab sooja vett, seepi ning vahutamist ja küürimist umbes kahe minuti jooksul. Käte desinfitseerimisvahendit saab kaasas kanda väikestes pudelites ning paljudel juhtudel kulub umbes 30 sekundit puhastamiseks, et saavutada seebi ja veega samad eelised.
Kuid kätepuhastusvahend ei ole kõigi puhastusvajaduste jaoks tõhus. Teatud bakterid muudavad selle kasutamise haiglatingimustes oluliseks. Siiski ei saa see käsi tõhusalt puhastada, kui need puutuvad kokku vere või väljaheitega.
Kätepuhastusvahend ei ole tõhus toitlustussektoris, kus käsi hoitakse toidu valmistamise ajal sageli märjaks. See ei suuda tõhusalt eemaldada kätel olevaid väljaheiteid, mis on tekkinud pärast vannitoa kasutamist halva kätepesu või sõnnikus kasvanud köögiviljade käitlemisel. Kehavedelike või mustusega kokkupuutumine nõuab hoolikat kätepesu.
Samuti ei tohiks see toode asendada kätepesu haiglatingimustes ega muudes tingimustes. Üldiselt annab kätepuhastusvahend parima tulemuse, kui seda kasutatakse pärast käte põhjalikku pesemist. See kehtib eriti pärast vannitoa kasutamist. Paljud haiglad on nüüdseks kehtestanud eeskirjad, mis nõuavad patsientide vahel desinfitseerimisvahendi kasutamist ja käte pesemist pärast nelja kasutamist. Lisaks tuleb iga kord, kui meditsiinitöötaja puutub kokku kehavedelikega, käsi pesta.
Käte desinfitseerimisvahend ei tööta tõhusalt, kui seda ei kasutata õigesti. Inimesed vajavad vähemalt peenraha suurust nukke ja peaksid suutma käsi 30 sekundit koos hõõruda. Kui desinfitseerimisvahend kuivab lühema ajaga, on tõenäoline, et seda ei kasutatud piisavalt ja inimene peaks protsessi kordama.