Mikrolaineahjus popkorni kasutuselevõtt 1980. aastatel tundus loomulik edasiminek pärast pliidiplaadil popkorni ja õhuga popkorni edu. Tarbija asetab kokkuvolditud koti, mis sisaldab õli, maitseaineid ja popkorni tuumasid, mõneks minutiks mikrolaineahju. Tulemused võisid olla erinevad, alates pooleldi avanenud kotist kuni suitsukotti, kuid üldiselt sarnanes mikrolaineahjus valmistatud popkorn muude popkorni vormidega ja valmis palju lühema ajaga.
Küsimused mikrolaineahjus kasutatava popkorni ohutuse kohta hakkasid tekkima, kui mitmed popkornivabriku töötajad teatasid popkorni töötlemiseks kasutatavate kemikaalidega töötades tõsistest hingamisteede probleemidest. Täpsemalt, diatsetüülina tuntud kemikaal oli arvatav ärritaja. Diatsetüüli kasutatakse võimaitse loomiseks erinevates maitseainetes ja töödeldud toitudes, sealhulgas kunstliku või maitseainena, mida kasutatakse mikrolaineahjus popkorni jaoks. Väikest kogust diatsetüüli ei peeta mürgiseks, kuid tehaseskaalal kuumutamisel võivad aurud vallandada hingamisteede haigusseisundi, mida nimetatakse popkorni kopsudeks.
Kui kuuldus popkornitöötajate kokkupuutest diatsetüüliga sai avalikuks, hakkasid paljud tervishoiutöötajad muret tundma mikrolaineahjus kasutatava popkorni ohutuse pärast tarbijate tasandil. FDA ja teised agentuurid tegid kindlaks, et keskmises kotis sisalduv diatsetüüli kogus ei jõudnud mürgiste tasemeteni, kuigi kriitikud seadsid kahtluse alla nende leidude paikapidavuse pärast seda, kui avastasid, et tarbijate tasandil on testitud vähe või üldse mitte. Peaaegu kõik teatatud popkornikopsujuhtumid esinesid popkornivabriku töötajatel, kuid üks tarbija, kes sõi iga päev kaks kotti popkorni ja tundis tavaliselt aurude lõhna, haigestus haiguse kergemasse vormi.
Kui mikrolaineahju popkorniga on üldse mingit ohtu seostatud, on see kõige suurem siis, kui kott esmakordselt avatakse ja kuumutatud aurud väljuvad. Nende aurude sissehingamine avaldab tarbijale võimalikult kõrge diatsetüüli taseme tarbija tasandil. See võib kahjustada väikseimaid õhukäike tarbija kopsudes või vallandada juba olemasoleva astmahoo. Väikestel lastel ja kahjustatud kopsumahuga inimestel võib tekkida kõrvaltoime ka pärast kuuma mikrolaineahju popkorni koti esimeste aurude sissehingamist.
Teisi mikrolaineahjus popkornis sisalduvaid koostisosi ei peeta mürgiseks, kuigi mõned terviseeksperdid hoiatavad kõrge naatriumisisalduse või osaliselt hüdrogeenitud õlide tarbimise eest. Tavaliselt kasutab see tervislikumaid õlisid, mida teatud filmistiilis popkornis serveeritakse kinodes või kontsessiooniboksides. Kunstvõi või lisasoola lisamise vältimine on alati hea mõte tervislikuma vahepala jaoks.