Meeste ja naiste anatoomia ja isiksuste erinevused on kõigile teada, kuid alles suhteliselt hiljuti on tehtud uuringuid, mis näitavad, et ka mehe ja naise ajus on olulisi erinevusi. Need erinevused võivad olla üsna väljendunud ja paljudel juhtudel põhjustavad tunnuseid, mis kehtivad üldiselt rohkem naiste kui meeste kohta ja vastupidi. Meeste ja naiste aju struktuurid ja süsteemid on põhimõtteliselt sarnased, kuid nende töö- ja lõimumisviisid võivad olla väga huvitavad ja isegi üllatavad.
Kõigepealt tuleb märkida, et üheski teaduslikus uuringus ei ole leitud erinevust sugudevahelises üldises intelligentsuse tasemes. See pole muidugi väike asi, kuid mehe ja naise aju iseloomu ja suhtelise eelise poolest erinevad. Üks erinevus, mis on olnud teada juba mõnda aega, on see, et meeste aju sisaldab keskmiselt umbes neli protsenti rohkem rakke kui keskmine naiste aju, mistõttu see kaalub umbes 3.5 untsi (100 g) rohkem. Kuigi naise aju sisaldab veidi vähem ajurakke, sisaldab see ka suuremat arvu rakkudevahelisi ühendusi. Need üldised erinevused võivad muu hulgas põhjustada erinevaid viise, kuidas mehed ja naised töötlevad keelt, hindavad objekti kiirust ja hindavad aja möödumist.
See viitab millelegi, mida enamik meist oma kogemusest teab, nimelt et mehed on sageli suurepärased ülesannetega, mis nõuavad keskendumist aju kohalikele piirkondadele, näiteks matemaatika. Naised seevastu on üldiselt paremad teabe assimileerimisel ja integreerimisel sellisteks kasutusteks nagu verbaalne väljendus. See ei ole lihtsalt tavaline kultuuriline tähelepanek, kuna see leiti olevat teaduslikult põhjendatud järeldus 2004. aastal California ülikooli Irvine’is läbi viidud uuringus.
Teine erinevus meeste ja naiste aju vahel on korpuseks kutsutava struktuuri suurus. See on tegelikult kiirtee, mis ühendab kahte ajupoolkera. Naiste kollaskeha kipub olema suurem kui meestel. See võrdub kiirema andmeedastuskiirusega poolkerade vahel, mis annab naistele parema juurdepääsu mõlemale poolele, eriti keele osas. Mehed seevastu kipuvad olema “vasakpoolse ajuga” ehk loogilisemad ja analüütilised kui naised. Samuti on väidetud, et naiste kollosumi suurem suurus võib põhjustada nähtust, mida me nimetame “naiste intuitsiooniks”.
Aju sügav limbiline süsteem on veel üks koht, kus meeste ja naiste aju vahel on olulisi erinevusi. See süsteem on naise ajus suurem kui mehe ajus, võimaldades naistel sageli oma ja teiste tunnetega rohkem kursis olla. Selle tulemuseks on ka naiste suurem võime teiste inimestega suhelda ja nende eest hoolitseda, võrreldes meestega. Limbilise süsteemi erinevused on tõenäoliselt vastutavad selle eest, et naisi peetakse igas tuntud kultuuris väikelaste peamiste hooldajatena.