Mahepõllukultuure kasvatatakse ilma pestitsiide ja muid naftapõhiseid kemikaale kasutamata ning selle asemel kasutatakse looduslikke meetodeid, mida põllumehed on kasutanud tuhandeid aastaid. Need meetodid hõlmavad külvikorda, kattekultuure ja komposti maa väetamiseks ning looduslikke meetodeid, et vältida või puhastada põllukultuure putukate ja muude kahjurite eest. Lisaks ei kasvatata mahepõllukultuure seemnetest, mida on geneetiliselt muundatud. Põllumajandustootjad kasutavad mahepõllumajanduslike põllukultuuride kasvatamiseks meetodeid, kuna neid peetakse keskkonnasõbralikumaks ja ohutumaks, kuna neil ei ole kemikaalide jääkide jälgi.
Kuni põllukultuure kasvatatakse teatud meetodeid kasutades, peetakse neid mahepõllumajanduslikeks põllukultuurideks. Mahepõllukultuuride tähistusi loovad erinevad valitsusasutused, kes määratlevad eeskirjad, mida tuleb sellesse kategooriasse kaasamiseks järgida. See tähendab, et seal võib olla orgaanilisi puuvilju, köögivilju, teravilju, lilli ja paljusid muid mahepõllumajanduslike põllukultuuride sorte.
Suure osa mahepõllumajanduslikust tootmisest moodustab maa väetamiseks looduslike tehnikate kasutamine. Viljavaheldus on planeeritud maakasutus talus, nii et igal taluosal on veidi aega puhata ja kosuda, ilma et seal kasvaks põllukultuure. Põllumajandustootjad peavad arvestama kasvu mõjuga igale maa-alale, samuti oma vajadustega kasvatada teatud kogus põllukultuure hooaja jooksul. Kattekultuure kasvatatakse kas müüdavate põllukultuuride vahel, mida nimetatakse sularahakultuuriks, või külvikorra ajal. Need taimed aitavad mulda toitainetega täiendada, seega valitakse kattekultuurid mulla vajadustest ja taimede võimetest lähtuvalt.
Kompost aitab maad looduslikult väetada, kasutades toitaineterikkaid jääkaineid, mis lõpuks muutuvad mullaks. Samuti aitab see kahjureid põllukultuuridest loomulikult eemal hoida. Muud looduslike pestitsiidide meetodid hõlmavad looduslike kemikaalide kasutamist, põllukultuuride ümber tõkete istutamist ja looduslikult kahjurite tõrjet tõkestavate põllukultuuride istutamist.
Mahepõllumajanduslike põllukultuuride kasvatamisel ja söömisel on palju eeliseid, sealhulgas maa jätkusuutlikkus, mullas ja põllukultuurides sisalduvate toitainete suurenemine ning veesüsteemide väiksem reostus. Tänu sellele, et mullas, kus mahekultuure kasvatatakse, on rohkem toitaineid, tähendab see ka seda, et taimedelt tarbitavas toidus on toitaineid rohkem. Mahepõllumajanduslikel põllukultuuridel ei ole tavaliselt pestitsiide ega kemikaale, mis võivad olla kahjulikud inimeste ja muude loomade kehale.