Patogeensed bakterid on bakterid, mis võivad põhjustada haigusi. Inimesi huvitavad üldiselt kõige rohkem bakteriliigid, mis võivad inimestel haigusi põhjustada, kuigi need bakterid võivad nakatada ka teisi loomi ja taimi. Mõned märkimisväärsed patogeensed bakterid on paljude teiste hulgas streptokokk, stafülokokk, tuberkuloos ja Escherichia coli. Kogu maailmas põhjustavad need bakterid paljusid haigusi ja epideemiaid.
Intratsellulaarsed bakterid on patogeensed bakterid, mis inimkehasse sattudes põhjustavad alati haigusi, vastupidiselt tingimuslikele bakteritele, mis võivad teatud asjaoludel põhjustada infektsioone ja haigusi. Paljud bakterid on tingimuslikud, kasutades ära juhust nagu lahtist haava, et end paljundada ja haigusi levitada. Oportunistlikud bakterid on bakterid, mis tavaliselt ei põhjusta haigusi, kuid põhjustavad seda, kui patsiendi immuunsüsteem on kahjustatud.
Paljudel inimestel on igal ajahetkel tegelikult suur hulk baktereid. Neid baktereid nimetatakse kommensaalseteks või “headeks” bakteriteks, kuna nad täidavad inimkehas olulisi ja kasulikke funktsioone. Soolestiku kommensaalsed bakterid aitavad näiteks toitu lagundada ja seedida.
Patogeensed bakterid võivad inimpopulatsiooni kaudu levida mitmel viisil. Õhk, vesi ja pinnas on kõik tavalised vektorid ning inimesed võivad ka füüsilise kontakti kaudu baktereid üksteisele otse edasi anda. Mõned bakterid on väga osavad asukohtade, näiteks ukselinkide ja meditsiiniseadmete koloniseerimisel, võimaldades neil hõlpsalt inimeselt inimesele liikuda, samas kui teised on palju vähem virulentsed ja surevad, kui nad on liiga kaua peremeesorganismist eemal.
Tuberkuloos on üks maailma juhtivaid tapjaid, mistõttu on see eriti huvipakkuv patogeenne bakter. Patogeensed bakterid põhjustavad ka sooleprobleeme, nagu krooniline kõhulahtisus, ja võivad põhjustada infektsioone paljudes kehaosades. Mõned neist on surmavad, nagu Legionella bakter, samas kui teised on suhteliselt healoomulised, eriti kui on võimalik ravida. Üks suurimaid probleeme arengumaades on ravitavate bakteriaalsete infektsioonide levik, mis levivad kontrollimatult läbi elanikkonna, kuna puudub juurdepääs ravimitele ja ravile.
Patogeense bakteriga nakatumise ravi hõlmab antibiootikumide kasutamist – ravimeid, mis on spetsiaalselt loodud bakterite hävitamiseks. Mõnedel bakteritel on tekkinud antibiootikumiresistentsus, mis tähendab, et nad ei pruugi reageerida paljudele tavalistele antibiootikumidele. See sunnib ravimifirmasid uurima uusi antibiootikume, et nad suudaksid bakteriaalsetest mutatsioonidest ette jääda.