Kuigi enamik naisi seda ei oota, on iga-aastane günekoloogiline läbivaatus hädavajalik. Tavaline günekoloogiaeksam algab tavaliselt küsimuste ringiga. Seejärel registreeritakse patsiendi kaal, vererõhk ja pikkus ning tal antakse käsk lahti riietuda. Seejärel uurib arst tema rindu ja suguelundeid.
Arstid ja õed esitavad tavaliselt günekoloogilise läbivaatuse ajal mitmeid küsimusi. Näiteks patsiendi esimese günekoloogilise läbivaatuse ajal küsitakse talt tõenäoliselt nii tema haiguslugu kui ka perekonna haiguslugu. Harvad pole ka küsimused menstruaaltsükli, seksuaalse aktiivsuse, rasestumisvastaste vahendite ja varasemate raseduste kohta.
Pärast seda, kui õde on registreerinud patsiendi kaalu, pikkuse ja elutähtsad näitajad, juhendab ta teda riided seljast võtma. Patsiendile antakse õhuke paberist kleit ja võib-olla ka leht. Enamik günekoloogiakabinette lubab aga naistel sokid jalga jätta.
Seejärel siseneb arst uuringuruumi. Temaga peaks alati kaasas olema naisõde. See aitab tagada, et patsient on kaitstud igasuguse seksuaalse kuritarvitamise eest. Samuti aitab see kaitsta arsti valeväidete eest.
Rindade uuring on tavaliselt günekoloogilise läbivaatuse füüsilise osa esimene osa. Selle läbivaatuse ajal kontrollib arst tavaliselt esmalt visuaalselt rindu. Seejärel tunneb ta neid mis tahes kõrvalekallete, näiteks tükkide suhtes. Seda tehes võib ta patsienti teavitada ka sellest, kuidas kodus rindade enesekontrolli teha.
Vaagna uuring on tavaliselt günekoloogilise läbivaatuse järgmine osa. Selle uuringu tegemiseks peab patsient liigutama oma puusad uuringutabeli lõppu. Seejärel toetab ta jalad eksamilaua lõpus kahes jalus ja ajab põlved laiali. Mõnel günekoloogilise läbivaatuse laual on ka patsiendi põlvedele eraldi tugitoed.
Günekoloog kontrollib esmalt tupe välist osa, otsides nakkuse või sugulisel teel levivate haiguste tunnuseid. See võib hõlmata selliseid asju nagu ärritus, eritis, haavandid või isegi parasiidid nagu häbemetäid. Kui see kontroll on lõppenud, jätkab ta sisemiste suguelundite uurimist.
Selleks vajab ta tööriista, mida nimetatakse täkkeks. Seda instrumenti kasutatakse tupe seinte laiali laotamiseks ja see on tavaliselt valmistatud plastikust või metallist, mis võib olla üsna külm. Enamik arste määrib tööriista või tupe sisestamise hõlbustamiseks, kuid paljudele patsientidele võib see olla üsna ebamugav. Kui tupe seinad on levinud, saab arst näha patsiendi emakakaela. Tavaliselt kogub ta emakakaelast lima ja rakkude proove. Neid proove saab kasutada teatud haigusseisundite, nagu sugulisel teel levivate haiguste ja vähi diagnoosimiseks.
Paljudel juhtudel pistab günekoloog ka sõrme tuppe ja vajutab teise käega kõhtu. Seda tehes saab ta teada näiteks emakakaela asukoha ja suuruse. Ta võib ka öelda, kas nendes piirkondades on turse või infektsioon. Samuti ei ole harvad juhud, kui günekoloog torkab ühe sõrme pärasoolde, mis võib võimaldada tal tunda kõrvalekaldeid emaka taga.
Kuigi günekoloogi läbivaatus võib olla väga stressirohke, on oluline lõõgastuda, kuna kokkusurutud lihased muudavad läbivaatuse sisemise osa valulikumaks. Patsient saab lõõgastuda sügavalt sisse hingates. Arst võib proovida aidata patsiendil lõõgastuda ka väikese jutuga.