Haigusseisundid on homöostaasi ebaõnnestumise peamine põhjus, võimetus säilitada keha sisekeskkonnas füsioloogilist tasakaalu. Haigusega seotud protsesside tõttu muutub kudede ja elundite talitlus nii, et see põhjustab tõsiseid kohanemishäireid, nimelt neeru- ja immuunsüsteemi talitlust mõjutavate haiguste korral. Käivitatakse teatud mehhanismid, mis kaitsevad keha sissetungivate patogeenide eest, kuid süsteem võib mõnikord ekslikult endaga võidelda. Inimese vananedes vähenevad elundisüsteemide võimed, mis häirib homöostaatilist funktsioneerimist, mida tõendavad Alzheimeri tõbi ja südame rütmihäired.
Äkiline neerufunktsiooni häire võib põhjustada tõsiseid probleeme homöostaasi ebaõnnestumise tõttu, kuna need olulised elundid aitavad verel eemaldada kahjulikke toksiine ning säilitada tõhusat vedeliku ja elektrolüütide taset. Kasvajad ja neerukivid võivad takistada uriini eritumist kuseteede ummistuste tekke tõttu, samas kui teatud tüüpi ravimid võivad samuti häirida neerude tööd. Hemorraagia korral väheneb neerude vereringe, mis põhjustab ägedat neerupuudulikkust, mida iseloomustavad tursed, iiveldus ja krambid. Tulemuseks võib olla ka kooma.
Temperatuuri reguleerimise mehhanismid on häiritud nakkusetekitajate esinemise tõttu kehas, eriti neil, kellel on nõrgenenud immuunfunktsioon. Palavik on üks olulisemaid viise, kuidas keha võitleb infektsioonide vastu, kuna hüpotalamus tõstab sisetemperatuuri, põhjustades külmavärinaid ja väsimust. Tavaline kehatemperatuur on umbes 98.6 ° Fahrenheiti (37 ° C), kuid palavik areneb tavaliselt umbes 100 ° Fahrenheiti (38 ° C) juures. Kuigi palavikku saab kontrolli alla saada palavikualandajateks nimetatud ravimite ja muude sekkumistega, vabastab kõige tõhusam ravi keha patogeenist.
Immuunsüsteemi võime eristada ennast tõelistest patogeenidest võib mõnikord ravi segada. Näiteks võib elundisiirdamist või vereülekannet saav patsient kogeda reaktsiooni, mis võib viia homöostaasi ebaõnnestumiseni, kuna immuunsüsteemil on palju võimalusi, kuidas inimkeha kaitsmiseks loodud mehhanismid võivad ebaõnnestuda. Mõnikord tekib ülitundlikkus, ülemäära erutuv immuunvastus antigeenile, mis tavaliselt ei põhjusta reaktsiooni, näiteks allergiline reaktsioon mesilase nõelamisele.
Vananemise käigus toimuvad muutused toovad kaasa vanemate inimeste funktsioneerimise vähenemise. Inimkeha erinevate süsteemide võimekuse vähenemine, ehkki kõige ilmsem eakatel inimestel, võib alata palju varem, näiteks Alzheimeri tõve korral. Keha süsteemid langevad erinevates punktides, põhjustades homöostaasi häireid närvide ja teiste organite funktsioonide halvenemise tõttu.