Mõned kõige levinumad tegurid, mis võivad mõjutada emaka limaskesta paksust, on hormonaalne tasakaalustamatus ja ebanormaalselt lühikesed menstruaaltsüklid. Naisel võib esineda probleeme ka emaka limaskesta paksusega võetavate viljakusravimite või emaka verevarustuse häirete tõttu. Oma osa võivad mängida ka seda suguelundit otseselt mõjutavad seisundid, samuti infektsioonid ja armid.
Kõige levinumate emaka limaskesta paksust mõjutavate probleemide hulgas on need, mis on seotud hormoonidega. Reproduktiivtervise tagamiseks peavad naise hormoonid tavaliselt olema heas tasakaalus. Naise emaka limaskesta võib ebasoodsalt mõjutada, kui östrogeeni tase tema kehas on liiga madal, ja hormoon progesteroon võib samuti mõjutada emaka limaskesta. Näiteks kui inimese kehas on liiga vähe progesterooni, võib tal tekkida seisund, mida nimetatakse endomeetriumi hüperplaasiaks, mida iseloomustab emaka limaskesta liigne paksenemine. Liiga vähe progesterooni võib põhjustada ka naise limaskesta eraldumist menstruaaltsükli ajal liiga vara.
Teine probleem, mis võib mõjutada emaka limaskesta paksust, on ebanormaalne menstruaalverejooks. Kui naise menstruaaltsükkel on ebatavaliselt lühike või tal on kogu tsükli jooksul ebanormaalne verejooks, ei pruugi vooder kunagi kasvada nii paksuks, kui eeldati. See on eriti oluline, kui naine üritab rasestuda, kuna viljastatud munaraku edukaks implanteerimiseks on äärmiselt paks vooder.
Ebapiisav verevool emakasse võib samuti negatiivselt mõjutada naise emaka limaskesta paksust. Selle organi verevoolu võivad häirida mitmed probleemid. Kõige levinumad on kõrge vererõhk (mida nimetatakse ka hüpertensiooniks), vere hüübimishäired ja mõnikord seisund, mida nimetatakse polütsüstiliste munasarjade sündroomiks, mida iseloomustavad mitmed munasarjatsüstid.
Mõnikord võivad ravimid, mida naine rasestumisvõimaluste suurendamiseks kasutab, takistada emaka limaskesta paksenemist. Näiteks muudavad mõned viljakusravimid protsesse, mida keha läbib hormoonide tootmiseks ja võimalikuks raseduseks valmistumiseks. Sellisena õhutavad mõned neist ravimitest emaka limaskesta. Seda saab mõnel juhul parandada, võttes mõne muu ravimi, lõpetades nende kasutamise või lisades täiendavat östrogeeni.
Kõik, mis mõjutab emakat negatiivselt, võib kaasa aidata emaka limaskesta paksuse muutumisele. Näiteks võib inimesel olla emakaoperatsiooni või emakainfektsiooni tagajärjel hõrenenud emaka limaskesta. Selle probleemi võib põhjustada ka emaka armistumine.