Meditsiinilises terminoloogias viitab “gastro” maole. Seedetrakti infektsioon mõjutab magu või soolestikku ja põhjustab tavaliselt kõhulahtisust. Mõned infektsioonid, nagu E. coli ja shingella, on põhjustatud bakteritest. Teised, näiteks Norwalk ja Sapporo, on põhjustatud viirustest. Giardia on parasiitide põhjustatud seedetrakti infektsioon.
Paljud neist infektsioonidest on väga nakkavad. Seedetrakti infektsioon võib levida, kui inimene, kelle kätel on mikroobide jälgi, puudutab teist inimest või teise inimese toitu. Salmonella on sellisel viisil leviv bakteriaalne infektsioon. Seda leidub sageli munades ja kanades. Kui neid tooteid ei käsitseta korralikult või ei kuumtöödelda põhjalikult, võivad inimesed haigestuda.
Shingella on ka bakterite põhjustatud seedetrakti infektsioon. Shingella levib tavaliselt saastunud aine, näiteks vee allaneelamisel. Bakterid võivad põhjustada düsenteeriat, mis on haigus, mille korral soolestik paisub. Sooleseina vooderdav lima hakkab üldiselt lagunema ja võib ilmneda soolestiku liikumisel. Inimesel võivad selle infektsiooni tagajärjel tekkida ka veritsevad haavandid.
E. coli on seedetrakti infektsioon, mis võib põhjustada inimesel verise kõhulahtisuse. Seda infektsiooni põhjustavad bakterid, mida sageli leidub toidus, näiteks osaliselt toores veiselihas. Kui inimene nakatub E. coli-sse, tabavad teda tõenäoliselt karmid krambid. Kui ta ei pese hoolikalt käsi pärast vannituppa minekut, võib nakkus kergesti levida kogu tema kodus või töökohas.
Giardia on kõva kestaga parasiit, mis võib elada inimese soolestikus ja põhjustada tema haigestumist. Kui nakatunud inimesel on väljaheide, vabaneb parasiit ja suur hulk mikroobe. Giardia levib peamiselt allaneelamise kaudu. Kuna parasiit kipub olema kloori suhtes vastupidav, piisab väikesest kogusest saastunud veest, mis ujumise ajal alla neelatakse, et nakatuda. Loomad kannavad ka baktereid ja nende jäätmed saastavad sageli looduslikke veeallikaid, nagu järved ja tiigid, kus inimesed võivad samuti nakatuda.
Norwalki viirus, mis sai nime selle koha järgi Ohios, kus see avastati, omab paljusid samu omadusi, mis bakterite või parasiitide põhjustatud seedetrakti infektsioonidel. Nakkus levib sageli siis, kui saastunud kätega inimesed puutuvad kokku toiduallikaga. Toorelt või osaliselt kuumtöödeldult söödud mereannid võivad samuti viirust edasi kanda, kuna paljud veeallikad on saastunud loomsete ja inimeste jäätmetega. Positiivne erinevus Norwalki viirusega on aga see, et see põhjustab üldiselt lühemaid ja kergemaid infektsioone kui paljud bakterid ja parasiidid.