Fenüülefriinvesinikkloriidi kõige sagedasemad kõrvaltoimed on maoärritus, pearinglus ja peavalu. Mõnedel inimestel võivad tekkida ka unehäired ja närvilisus. Enamik inimesi, kes võtavad fenüülefriinvesinikkloriidi, ei märka mingeid kõrvaltoimeid ja kogetud kõrvaltoimed on tavaliselt väikesed. Kuigi see on haruldane, kogevad mõned inimesed selle ravimi võtmisel tõsiseid kõrvaltoimeid, nagu ebaregulaarne südametegevus, urineerimisraskused ja krambid. Võib esineda ka inimesi, kes on fenüülefriinvesinikkloriidi suhtes allergilised ja nende kõrvaltoimeteks võivad olla sügelus ja turse koos lööbega.
Fenüülefriinvesinikkloriidi kasutatakse tavaliselt dekongestantina ja see võib olla kasulik inimestele, kellel on allergiast või külmetushaigusest põhjustatud ninakinnisus. See ravim võib leevendada nina ja kõrvade turset, mis peaks hõlbustama hingamist inimestel, kellel on põsekoopaprobleemid. Need dekongestandid on saadaval nii käsimüügis kui ka retsepti alusel ning on tavaliselt väga väikeste laste puhul ebaefektiivsed. Arstid soovitavad tavaliselt vanematel mitte anda fenüülefriinvesinikkloriidi alla kuueaastastele lastele, kuigi mõnikord määravad arstid seda ka noorematele lastele, kui nad arvavad, et sellest saadav kasu kaalub üles võimalikud riskid.
Inimesed, kes soovivad kasutada fenüülefriinvesinikkloriidi külmetuse või põskkoopaprobleemide korral, võivad kõrvaltoimeid vältida, kui võtate ravimit õigesti. Järgida tuleb annustamisjuhiseid ja ravimit ei tohi võtta soovitatust sagedamini. Lisaks annustamisjuhiste järgimisele võib olla kasulik võtta seda dekongestanti koos toiduga. Maoärritus on üks fenüülefriinvesinikkloriidi kõige sagedamini teatatud kõrvaltoimeid ja ravimi võtmine koos toiduga võib selle kõrvaltoime tekkimist vältida. Inimesed, kes võtavad mis tahes tüüpi väljakirjutatud ravimeid, peaksid enne selle ravimi võtmist küsima oma arstilt, et vältida ravimite ohtlikku koostoimet.
Kui fenüülefriinvesinikkloriidi võtmisel tekivad tõsised kõrvaltoimed, tuleb ravim koheselt katkestada. Rasedad või rinnaga toitvad naised peaksid enne mis tahes tüüpi dekongestantide võtmist küsima oma arstilt, sest mõnda dekongestandid ei pruugi olla raseduse ajal ohutud ja ohutuid dekongestante võib olla vaja võtta erinevas annuses, kui etiketil soovitatud. Hallutsinatsioonid, minestamine ja pindmine hingamine on kõrvalnähud, mis tekivad sageli siis, kui inimesed võtavad dekongestantide üledoosi, ning kui inimesel tekivad need nähud pärast dekongestantide võtmist, tuleb viivitamatult ühendust võtta mürgistusjuhtimiskeskuse või hädaabiteenistusega.