2010. aasta seisuga testiti ja kasutati inimestel kahte tüüpi hepatiidivaktsiine. Igaüks neist toimib väga erinevalt, kuna esimene ei ole vaktsiin selle sõna traditsioonilises tähenduses. Selle asemel, et takistada subjektil viirusesse nakatumast, aitab see organismil võidelda olemasoleva infektsiooniga, tugevdades immuunvastust. Kummagi vaktsiini saanud patsientidest on ainsad C-hepatiidi vaktsiini kõrvaltoimed süstekoha valu ja hellus. See ei tähenda, et lõpuks rohkem kõrvaltoimeid ei avastataks, sest vaktsiini on manustatud vaid piiratud arvule inimestele.
C-hepatiidi viirus (HCV) põhjustab maksapõletikku ja lakkab korralikult töötamast. See on kõigist hepatiidi vormidest kõige surmavam, sest kuni viimase ajani polnud vaktsiini ennetusmeetodit saadaval. Välja on töötatud kahte tüüpi HCV vaktsiine ja neid on kasutatud piiratud arvul inimestel. Loodetavasti on nende kasutamine lõpuks laialt levinud.
Esimest tüüpi vaktsiini manustatakse pärast seda, kui viirus on juba võimust võtnud. Patsientidele süstitakse ainet, mis aitab tugevdada immuunsüsteemi vastust viirusele ja aitab parandada maksafunktsiooni, puhastades viiruse maksast kiiremini. Teine vaktsiin sarnaneb suuresti kõigi teiste vaktsiinidega, kuna see kasutab viiruse surnud või mitteaktiivset versiooni, et tekitada immuunvastust. Kui immuunsüsteem loob inaktiivse viiruse vastu antikehi, suudab keha sellega kokku puutudes päris asja vastu võidelda.
C-hepatiidi vaktsiini kõrvaltoimed on hõlmanud valu ja hellust süstekohas. Need on tavaliselt kerged ja kestavad päeva või vähem. Mõnel inimesel võib esineda ka punetust. Kuna C-hepatiidi vaktsiini kõrvaltoimeid ei ole laialdaselt uuritud, võib julgelt eeldada, et kui rohkem inimesi vaktsineeritakse, ilmnevad täiendavad sümptomid. Sagedased kõrvaltoimed, mis ilmnevad enamiku vaktsiinide, sealhulgas B- ja A-hepatiidi vaktsiinide puhul, on valu ja turse, kerge palavik, iiveldus, väsimus, peavalu, pearinglus ja mõnikord oksendamine. Need on tavaliselt kerged ja kõige raskemad neist esinevad vaid vähesel arvul inimestel.
Muud võimalikud C-hepatiidi vaktsiini kõrvaltoimed hõlmavad allergilisi reaktsioone, kuigi 2010. aasta seisuga pole neist teatatud. Need võivad ulatuda kergest kuni raskeni ja põhjustada selliseid sümptomeid nagu õhupuudus, nahaärritus või nõgestõbi, pearinglus, suukuivus ja šokk. Kui mõni neist asjadest ilmneb ja on tõsine, tuleb viivitamatult pöörduda arsti poole. Need on anafülaktilise šoki tunnused ja võivad viivitamatu ravi puudumisel lõppeda surmaga.