Missense mutatsioon on teatud tüüpi geneetiline mutatsioon, mille puhul üks alus asendatakse teise alusega, muutes DNA kodeerivas järjestuses ühte “tähte”. Sõltuvalt sellest, kus mutatsioon toimub ja millist alust muudetakse, võib missense mutatsioon põhjustada terviseprobleeme või funktsionaalseid muutusi. Missense mutatsioonidega on seostatud mitmeid geneetilisi seisundeid ja neid mutatsioone seostatakse ka mitmete vähivormidega.
See mutatsioon on näide punktmutatsioonist, milles muutus üks nukleotiidalus. Üleminekul vahetatakse puriin teise puriini vastu või pürimidiin teise pürimidiini vastu. Transversioonides vahetatakse puriin ja pürimidiin. Kumbki neist muudab DNA järjestust, mis tähendab, et DNA võib kodeerida teistsugust valku, kui tervetel inimestel eeldatakse. Sõltuvalt sellest, kus geenis mutatsioon aset leiab, võib see põhjustada mitmesuguseid tagajärgi, kui DNA kodeerib erinevat valku.
Mõnel juhul funktsionaalset muutust ei toimu või on muutus, kuid see on minimaalne. Teistel juhtudel põhjustab vahetus tõsiseid tüsistusi, kuna keha ehitab täiesti erineva valgu. Mõned näited missense mutatsioonidest põhjustatud geneetilistest seisunditest hõlmavad tsüstilise fibroosi, sirprakulise aneemia ja amüotroofse lateraalskleroosi (ALS või Lou Gehrigi tõbi) vorme. Missense mutatsioone on seostatud ka vähktõvega, mis tekivad siis, kui raku jagunemine väljub kontrolli alt. Missense mutatsiooni esinemise kinnitamiseks on vaja teada, millised geenid on seotud patsiendi seisundiga, ja tuvastada geeni täpsed asukohad, kus kõrvalekalded esinevad.
Paljud missense mutatsioonid on spontaansed, põhjustatud rakkude jagunemise vigadest, mis põhjustasid transversiooni või ülemineku. Teised võivad olla põhjustatud kokkupuutest mutageenidega, nagu ohtlikud gaasid. Esimesed missense mutatsioonid tuvastati 1950. aastatel ja tänu DNA sekveneerimisele ja genoomi paremale mõistmisele on tänu DNA järjestamisele ja arusaamisele, kuidas sellised mutatsioonid toimivad.
Kui missense mutatsioon ei põhjusta funktsionaalseid muutusi, nimetatakse seda mõnikord konservatiivseks või vaikivaks mutatsiooniks. Inimesed ei pruugi sellistel juhtudel olla teadlikud asjaolust, et neil on mutatsioon. Missense mutatsioone, mis põhjustavad muutusi, tuvastatakse pidevalt. Vastuseks sellele uuele teabele on muutumas ka meditsiiniline arusaam geneetilistest haigustest, kuna teadlased saavad teada, et geneetiliste seisundite raskusaste võib olla väga erinev, sõltuvalt konkreetse patsiendi geneetilise materjali erinevustest.