Inimese papilloomiviiruse (tuntud ka kui HPV) põhjustatud infektsioonid põhjustavad tavaliselt ebanormaalseid papi määrdeid. Seda mõju võivad avaldada ka sellised haigused nagu herpes ja trihhomonoos. Muudeks põhjusteks on levinud harjumused, nagu seksuaalvahekord ja tampoonide kasutamine.
Üks levinumaid ebanormaalse papi määrdumise põhjuseid on HPV-nakkus. See kontakti teel leviv viirus nakatab mingil eluperioodil paljusid naisi. Paljud naised pole isegi teadlikud, et neil on viirus, sest enamikul juhtudel nakatutakse sellega, see ei põhjusta sümptomeid ja kaob lõpuks ise. Viirus võib siiski mõjutada papi määrdumist, kuna see võib põhjustada muutusi naise emakakaela rakkudes. Mõnel juhul ravitakse ebanormaalseid rakke, kuid see ei ole alati vajalik.
Teatud sugulisel teel levivad haigused (STD) võivad samuti põhjustada ebanormaalset papi määrdumist. Üks näide on trihhomonoos, mis võib põhjustada ebanormaalseid halolaadseid moodustisi emakakaela rakkudes. Erinevalt mõnest teisest sugulisel teel levivast haigusest kipub trikhomoniaas andma märke, et inimene on nakatunud. Nende hulka kuuluvad vahutav sügelev eritis, mis võib olla kollakas või hallikasroheline, ja valu urineerimisel. Sellised infektsioonid on tavalised ja ravitavad.
Teine suguhaigus, mis võib põhjustada ebanormaalset papi määrdumist, on herpes. Sellel viirusel pole teadaolevat ravi. See jääb kehasse, kus see mõnikord uinub, kuid kipub perioodiliselt liikuma naha pinnale. Kui see juhtub, tekivad tavaliselt villid, kuid need kaovad lühikese aja pärast. Kuigi herpesega inimesel ei esine alati sümptomeid, võib viiruse olemasolu organismis põhjustada rakumuutusi, mida saab tuvastada pap-testiga.
On ka teist tüüpi infektsioone, mis võivad samuti põhjustada ebanormaalset papi määrdumist. Näiteks pärmseente infektsioon ei ole suguhaigus. Naised võivad selliste infektsioonide all kannatada isegi siis, kui nad pole kunagi seksinud. See kehtib ka teiste bakteriaalsete infektsioonide puhul. Kuid need võivad mõjutada uuringu tulemusi.
Mõnel juhul ei ole probleem mingi tingimuse tagajärg. Tavalised harjumused võivad olla ebanormaalse papi määrdumise põhjuseks. Üks hea näide on seksuaalvahekord. Naistel soovitatakse sageli enne papiproovi võtmist seksist hoiduda, kuna see võib mõjutada tulemusi. Teine levinud harjumus, mis võib tulemusi mõjutada, on tampoonide kasutamine.