Kuigi nahk on koduks paljudele erinevatele mikroobiliikidele, ei ole see oma kuivuse ja suhtelise soolasuse tõttu enamiku mikroorganismide jaoks kõige külalislahkem koht. Nahatampoon on viis, kuidas võtta proove nahal elavatest mikroobidest. Kuna arste huvitavad tavaliselt ainult nakkust põhjustavad bakterid, viirused või seened, siis tavaliselt ei võeta patsiendilt tervet nahka, vaid ainult nakatunud piirkondi. Teatud olukordades, näiteks kui tervishoiuasutuse juhtkond soovib tuvastada ohtlike patogeenide olemasolu, võib terve naha pühkida. See analüüsivorm on oluline ka mikroobiökoloogia ja haiguste leviku uurijatele.
Mikrobioloogias kasutatavad tampoonid on tavaliselt täiesti steriilsed materjalitükid. Tampoonide materjal võib olla pika käepideme otsas, et meditsiinitöötaja saaks seda hoida. On olemas erinevat tüüpi tampoone, kuid need kõik täidavad sama funktsiooni, milleks on pinda hõõruda, et eemaldada huvipakkuvad bioloogilised ained. Naha tampoonid on tavaliselt mõeldud mikroobide kogumiseks, samas kui mõned muud tüüpi tampoonid, näiteks emakakaela tampoonid, on mõeldud patsiendilt rakkude kogumiseks.
Kui patsiendil on nahal infektsioon, võivad tampooniproovid, mida meditsiinitöötaja võib infektsiooniproovi võtmiseks kasutada, kuuluda nahatampooni määratluse alla. Tavaliselt võtab arst proovi nakatunud piirkonnast, näiteks abstsessist, mitte mõjutamata ümbritsevast nahast. Nakatunud piirkonnast mäda või vedeliku proovide võtmine on üldiselt siiski kasulikum kui tampooni võtmine. Käimas on uuringud nahatampooni kasutamise võimaluse kohta teatud tüüpi nakkushaiguste (nt klamüüdia) diagnoosimiseks invasiivsemate tampoonitestide asemel.
Teatud ohtlikud patogeenid võivad mõne inimese nahal kahjutult levida, kuid edasikandumisel ohustada teisi. Näiteks on metitsilliiniresistentne Staphylococcus Aureus (MRSA), mis on tihedalt seotud normaalse nahaflooraga, kuid on muutunud antibiootikumide suhtes väga resistentseks. See muudab bakteriga nakatumise väga riskantseks, eriti inimestele, kes on juba haiged või kellel on lahtised haavad.
MRSA võib reisida haiglatesse tervete või haigete inimeste nahal ja end haiglas sisse seada. Kui tervishoiuasutuse töötajad kahtlustavad, et MRSA võib esineda, võivad nad teha patsientidele naha tampooniproovi, et selgitada välja, kes bakterit kannab. Bakteri lemmikkohad kehal on nina küljed, käe all olevad alad ja nahk üldiselt.
Ka mikroobide looduslikke elupaiku uurivad teadlased tunnevad huvi nahatampoonide tulemuste vastu. Need esindavad mikroobide populatsiooni, mis võivad nahal loomulikult elada. Rahvastikuprofiili erinevused aja jooksul võivad teadlastele öelda, millised mikroobid seal pikalt elavad ja mis kasutavad nahka enne edasiliikumist ajutise koduna.