Paljud jooksjad, eriti need, kes osalevad maratonidel, kannatavad jooksja kõhulahtisuse all. Seisund, mida nimetatakse ka jooksja traavideks, põhjustab lahtist väljaheidet ja paneb jooksja tundma meeleheitlikku vajadust roojata kas jooksu ajal või vahetult pärast seda. Ühe hinnangu kohaselt mõjutab ebamugav ja piinlik seisund kuni 50 protsenti jooksjatest. Eksperdid pole põhjuses kindlad, kuid on olemas nõuandeid jooksja kõhulahtisuse ennetamise ja selle kohta, kuidas vähendada esinemissagedust ja hoida jooksjat kursil, mitte vannitoas.
Suur osa nõuannetest puudutab jooksja toitumise muutmist. Kiudainerikkaid toite tuleks 24 tundi enne plaanilist jooksu vältida, nagu ka gaase tekitavaid toite. Teine võimalik süüdlane, mida tuleks vältida, on suhkrualkoholid, teatud tüüpi magusaine, mis sisaldub suhkruvabades toiduainetes, nagu jäätis, kommid ja mõned suhkruvabad kummid. Mõned eksperdid soovitavad, et jooksja peaks vältima rasvaseid toite ja kofeiini umbes kolm tundi enne võistlust ning mõned jooksjad võivad leida, et nad peavad vältima neid aineid kuni kuus tundi. Samuti on soovitatav paar tundi enne jooksu täielikult söömisest loobuda.
Soovitused jooksjatele, kes üritavad vältida jooksja kõhulahtisust, hõlmavad ka ettevaatusabinõusid laktoositoodete (nt piim ja piimatooted) kasutamisel, sest teatud inimestel võib laktoos põhjustada kõhulahtisust. Jooksjad peaksid ka teadma, et energiabatoonid võivad põhjustada kõhulahtisust, nagu ka dehüdratsiooni. Vedeliku joomine on oluline, kuid jooksja peaks kõik soojad joogid kõrvale jätma, mis võib seedimist kiirendada.
Jooksjad, kes kardavad jooksja kõhulahtisuse kordumist, võivad soovida võtta oma riiete sobivuse osas täiendavaid ettevaatusabinõusid, sest liiga kitsad riided võivad probleemi veelgi süvendada. Teine kaitsemeede oleks piirata jooksu pikkust kuni paranemiseni. Kui probleem jätkub, võib kõhulahtisusevastase ravimi saamiseks pöörduda arsti poole. Mõned jooksjad lihtsalt veenduvad, et nad teaksid enne teele asumist tualettruumide asukohta.