Endometrioosi ja polütsüstiliste munasarjade sündroomi (PCOS) vahel on palju erinevusi. Üks peamisi erinevusi on seotud kehaosaga. Endometrioos on põhimõtteliselt seisund, mille puhul naise emaka tavaliselt vooderdavat kudet leidub väljaspool emakat; see põhjustab sageli valu, viljatust ja tugevat verejooksu. PCOS seevastu mõjutab peamiselt naiste munasarju. Seda iseloomustavad mitmed tsüstid naise munasarjades ja mitmed muud sümptomid, sealhulgas viljatus, akne, kehakaalu tõus ja ebaregulaarsed menstruatsioonid.
Inimene võib olla segaduses PCOS-i ja endometrioosi erinevuse pärast, kuna tingimused on mitmel olulisel viisil sarnased. Alustuseks on need seisundid, mis mõjutavad ainult naisi ja põhjustavad probleeme naiste reproduktiivsüsteemiga. Samuti on need mõlemad probleemid, mis võivad põhjustada ebaregulaarseid menstruatsioone. Lisaks võivad mõlemad need seisundid põhjustada või kaasa aidata mõjutatud naiste viljakuse probleemidele. Peale selle on need kaks tingimust aga väga erinevad.
Peamine erinevus PCOS-i ja endometrioosi vahel on mõjutatud reproduktiivsüsteemi osa. PCOS-i puhul on probleem keskendunud munasarjadele. Endometrioos hõlmab aga endomeetriumi kude, mis ilmub väljaspool emakat ja mõjutab teisi vaagnaelundeid. Näiteks võib see kasvada munasarjades, kuid võib mõjutada ka mitmeid teisi organeid. Lisaks võib kude moodustuda vaagnaõõne limaskestal ja muudel struktuuridel.
Sümptomid on veel üks viis, kuidas PCOS ja endometrioos erinevad. PCOS-i tavalisteks sümptomiteks on väikesed tsüstid munasarjades, viljatus, akne ja ebaregulaarsed menstruatsioonid või menstruatsiooni puudumine. Mõnedel selle seisundiga naistel on ka insuliiniga seotud probleemid, kõrgenenud vererõhk ja kolesteroolitase ning kaalutõus. Endometrioosi sümptomiteks on valu vaagnapiirkonnas, valu alaseljas ja roojamise muutused. Teised sümptomid võivad hõlmata tavapärasest tugevamat menstruatsiooniverejooksu, ebaregulaarset tupeverejooksu, viljatust ja veri uriinis.
Teadlased pole 100 protsenti kindlad, miks PCOS ja endometrioos tekivad, kuid oletatavad põhjused on erinevad. Näiteks arvavad teadlased, et endometrioosi põhjustab menstruaalvere varustamine naise vaagnasse ja kõhtu. Mõned arvavad, et naise vaagnas on primitiivseid rakke, mis võivad moodustada endomeetriumi kudesid. On isegi mõned uuringud, mis viitavad immuunsüsteemi vastuse probleemidele kui endometrioosi põhjustele.
Teadlased usuvad, et PCOS-i võivad põhjustada hormonaalsed kõrvalekalded, mis soodustavad tsüstide teket ja häirivad normaalset ovulatsiooni. Oma osa võivad mängida ka probleemid sellega, kuidas keha töötleb veresuhkrut. Naistel, kellel on PCOS, võib olla isegi geneetiline seos, kuna seda haigust põdevatel naistel on sageli ka lähisugulane, kellel on see haigus.