USA Toidu- ja Ravimiameti programm Hazardous Analysis and Critical Control Points (HACCP) on rahvusvaheliselt tunnustatud programm, mis aitab reguleerida USA-s müüdavate ja mitmetesse teistesse riikidesse eksporditavate toiduainete ohutust. Hügieen ja HACCP käivad käsikäes, sest puhtus on toiduainete inimtoidukõlblikuna hoidmisel ülioluline. Paljud HACCP juhised juhendavad tootjaid ja hulgimüüjaid kõige hügieenilisemate toidu säilitamise, valmistamise ja saatmise viiside kohta.
Hügieen ja HACCP ei kehti ainult toiduainete töötlemise eest vastutavate töötajate kohta. Näiteks mitmed piimatööstusele omased juhised kirjeldavad lüpsilautade, seadmete ja pastöriseerimispaakide puhtusnõudeid. Piima puhtana ja bakteritest saastamata hoidmisel on eluliselt tähtsad ka lehmadega seotud hügieenitavad; puhtad peavad olema mitte ainult lüpsiseadmed, vaid ka lehmad. HACCP-ga kirjeldatud hügieenitavade üksikasjad on täpsed, kuni kätepesuvahenditeni, mis peaksid olema töötajatele kättesaadavad, ja lehmade pesemise viisini enne lüpsi.
HACCP loob enamat kui lihtsalt juhised hügieeniprotsesside jaoks, mida inimesed peaksid järgima. Saadaval on ka koolitusprogrammid, mis sisaldavad teavet hügieeni ja HACCP kohta, milles kirjeldatakse ruumide ja seadmete hügieenilise korrashoiu õigeid tavasid ning isiklikke tavasid, nagu käte pesemine. Testimismaterjalid võivad aidata tööandjatel tagada, et nende töötajad teavad õige hügieeni olulisust toiduga töötamisel.
Üks suurimaid valdkondi, mida HACCP jälgib, on toitlustustööstus. Siin on hügieen mitmel põhjusel ülioluline. Toortoidud ja kuumtöödeldud toidud on sageli teineteise vahetus läheduses ning HACCP-l on programmilehed, mis kirjeldavad üksikasjalikult küpsetuspindade, pannide, nõude ja muude riistade õiget puhastamist, et tagada, et potentsiaalselt ohtlikud toortoidud, nagu kana, ei saastaks teisi toite. Toiduga kokkupuutuvate pindade nõuetekohase puhastamise vajadus loob olulise seose hügieeni ja HACCP vahel.
Hügieeni ja HACCP alla kuulub ka mahla- ja puuviljatööstuse suuniste kehtestamine. Siin on mahlaks muudetud puuviljade puhtus lõpptoote puhtuse seisukohalt ülioluline. Juhised hõlmavad teemasid, sealhulgas seda, kas puuvilju tuleks surve all pesta või mitte ja kui sageli tuleb säilituspaake põhjalikult puhastada, et säilitada hügieeniline keskkond. Muud hügieenilised protseduurid hõlmavad anumate steriliseerimist enne mahla villimist, kätepesujaamade loomist puuviljade käitlejatele ja järelejäänud viljaliha nõuetekohase kõrvaldamise tagamist.