Trüptofaan on asendamatu aminohape, mis on iga inimese dieedi normaalne komponent. Seda leidub enamikus inimeste poolt tarbitavates loomsetes toodetes, aga ka erinevates pähklites ja teraviljas. Üldiselt sisaldab enamik valgupõhiseid toite trüptofaani. Tavalise toiduga seedimisel trüptofaanil puuduvad tõelised kõrvalmõjud, kuid see võib põhjustada probleeme seoses teatud seedehäiretega ja eriti kui seda kasutatakse uneaine või antidepressandina. Ajaloolised väited kalkuni söömisest tingitud unisuse kohta pühade ajal, nagu USA jõulud ja tänupühad, on ebatäpsed, kuna uimasus on üldiselt ülesöömise tagajärg.
Kui seda võetakse käsimüügilisandina, on mitmeid võimalikke trüptofaani kõrvaltoimeid. Esiteks võivad trüptofaani toidulisandid põhjustada probleeme seoses teatud haigusseisunditega. Patsient peab enne trüptofaani võtmist alati konsulteerima oma arstiga, kui ta võtab praegu retseptiravimeid või kui ta on varem põdenud haigusi. Mõned inimesed on trüptofaani suhtes allergilised või neil on raskusi selle imendumisega seedimise ajal muude seisundite tõttu.
Mõned tüüpilised depressiooni või unetuse raviks kasutatavate trüptofaanilisandite kõrvaltoimed on unisus, pearinglus ja üldine erksuse vähenemine. Patsiendid, kellel ilmnevad trüptofaani võtmise ajal need sümptomid, peaksid vältima autojuhtimist ja raskete masinatega töötamist, samuti muid olukordi, kus tähelepanelikkuse puudumisel võivad olla ohtlikud tagajärjed. Täiendavad trüptofaani kõrvaltoimed võivad hõlmata suukuivust, peavalu, söögiisu vähenemist ja iiveldust. Kuigi need reaktsioonid trüptofaanile ei pruugi vajada viivitamatut arstiabi, tuleks konsulteerida arstiga, kui mõni neist trüptofaani kõrvaltoimetest muutub tavaliseks.
Lisaks nendele suhteliselt väikestele trüptofaani kõrvaltoimetele on üleannustamisest tingitud ka tõsisemaid haigusi. Kõhulahtisus ja oksendamine võivad tuleneda üleannustamisest ja vajada arstiabi. Segadus, erutuvus ja üldine hüperaktiivne käitumine võivad samuti viidata trüptofaani üledoosile, samuti liigsele higistamisele või külmavärinale, palavikule ja koordinatsiooni vähenemisele. Need ja teised sarnased sümptomid nõuavad tavaliselt viivitamatut arstiabi.
Enamiku trüptofaanipõhiste toidulisandite müük keelati USA-s 1991. aastal, kuna need osalesid eosinofiilia-müalgia sündroomi (EMS) puhangus. Keeld aga tühistati 2001. aastal, kuigi mõned piirangud jäävad kehtima, eriti seoses trüptofaani toidulisandite impordiga. Jääb teadmata, kas EMS-i puhang oli trüptofaani enda toode või valede tootmisprotseduuride põhjustatud lisandite tagajärg.