Filiaaliarvestus on mitme erineva raamatupidamisbüroo kasutamine ettevõtte finantsteabe salvestamiseks, aruandluseks ja haldamiseks. Iga arvestussüsteem on suurema organisatsiooni sees eraldiseisev ja üksteisest sõltumatu. Suure majandusüksuse kodukontoris on tavaliselt konto või pearaamatu pearaamatu jaotis, mis näitab iga filiaali finantsteavet. Pearaamatus oleval kontol on tavaliselt kirjeldav nimi, mis näitab, millise filiaali teave kontol on.
Paljud suured organisatsioonid või avalik-õiguslikud ettevõtted kasutavad oma tegevuses mingit filiaali raamatupidamist. See aitab ettevõttel hallata finantsteavet, ilma et tal oleks tegelikult filiaalides suurt füüsilist kohalolekut. Filiaali raamatupidamine vajab sageli tegevuste jälgimiseks raamatupidamisjuhti või järelevaatajat. See isik vastutab seejärel teabe värskendamise ja kodukontorist ad hoc projektide lõpuleviimise eest. Seda tüüpi raamatupidamisbüroode organisatsioonide eeliseks on võimalus vältida igas kohas kontrolleri või finantsjuhi olemasolu. Nendel ametikohtadel on sageli kõrged palgad, mis suurendavad ettevõtte tegevuskulusid.
Enamik raamatupidamiskontoreid kasutab kodukontori raamatupidamise pearaamatu väiksemat versiooni. Organisatsiooni peamine finantsjuht ja operatsioonide juht teevad koostööd ja loovad raamatupidamisbüroo töövoo reeglid. See tagab, et filiaali raamatupidamisbüroo suudab kogu vajaliku finantsteabe täpselt registreerida. Filiaalide asukohtades on sageli probleem allüksuste ja osakondadega, kes ei soovi ettevõtte üldiste eesmärkide saavutamisel koostööd teha. Põhjus, miks see juhtub, tuleneb sellest, et harukontor asub ettevõtte peamistest juhtidest nii kaugel. Juhid võivad olla vähem valmis koostööd tegema, kui nad ei karda ülemuste kättemaksu.
Auditid on peamine tööriist, mida kasutatakse ettevõtte filiaali raamatupidamiskontorite või kontorite terviklikkuse säilitamiseks. Kodukontor saadab välja siseaudiitorid, kes vaatavad raamatupidamistoimingud üle, et tagada nende tõhusus, täpne ja õigeaegne teabe salvestamine ja aruandlus. Sõltuvalt büroo varasemate auditite usaldusväärsusest võib tulevaste ülevaatuste sagedus olla üsna sagedane, kui avastatakse liiga palju varasemaid halbu raamatupidamistavasid. Kodukontori audiitorid tagavad ka, et filiaali raamatupidajad järgivad ettevõtte sisemist raamatupidamispoliitikat. Need reeglid langevad sageli kokku kehtivate riiklike raamatupidamisstandarditega, mida ettevõte kasutab finantsteabe salvestamiseks ja esitamiseks, või laiendavad neid.