Auditi metoodika on ülesannete või tegevuste jada, mille raamatupidamisbüroo läbib kliendi finantsteabe ülevaatamisel. Iga metoodika on tavaliselt erinev kliendi toimingute erinevuste tõttu. Auditi metoodika väljatöötamisel on neli etappi: planeerimine, välitööd, aruandlus ja järeltegevus. Igal etapil on mõned erinevad ülesanded, mida audiitorid peavad töötava metoodika täielikuks väljatöötamiseks täitma. Suur osa tööst tuleb pärast seda, kui ettevõte allkirjastab kliendiga kaasamiskirja.
Planeerimine toimub pärast seda, kui klient on esimest korda raamatupidamisfirmaga allkirjastanud. Audiitorid intervjueerivad ettevõtte juhtkonda ning koostavad auditiplaani ja ajakava. Auditi metoodika sisaldab ka esialgset ulatust. Audiitorid vaatavad üle varasemad auditiaruanded, praeguse teabe ja muu teabe, et teha kindlaks, kuidas välitööd lõpule viia. Varasemate finantsprobleemidega ettevõtetel võib raamatupidamisbüroo kõrgenenud auditiriski tõttu kliendist loobuda.
Välitöö on koht, kus audiitorid teevad suurema osa audititööst. Auditi metoodika kirjeldab valimi suurust, testimismeetodeid ja sisekontrolle, mida audiitorid peavad testima. Selle protsessi osaks on ka riskianalüüs. Audiitorid loovad põhihinnangu selle kohta, millised riskid on kliendi tegevuses valdavad. Riski tuvastamine välitööde varases etapis võimaldab audiitoritel arutada, kuidas nendele valdkondadele läheneda ja auditi metoodikat muuta, et tagada kliendi teabe täielik audit.
Auditi aruandluse faas on kogu protsessi lõpu algus. Auditi metoodika kirjeldab tavaliselt maatriksi mustandit, mille audiitorid oma kliendi jaoks ette valmistavad. Maatriks sisaldab lühikest aruannet auditi leidude ja üksuste olulise mõju kohta finantsteabele. Metoodika nõuab tavaliselt maatriksi mustandit, mida audiitorid enne ametliku auditiaruande väljastamist kliendiga arutavad. Audiitorid võivad muuta oma arvamust teatud leidude kohta, kui klient suudab tõestada, et üksused on ebatõenäolised.
Auditi järelkontroll on auditi metoodika viimane etapp. Kui klient saab märkustega või negatiivse auditiarvamuse, mis viitab probleemile jooksva finantsteabega, on nende probleemide vältimiseks vajalik teine audit. Auditi metoodika nõuab tavaliselt parandusauditit, mille käigus audiitorid pöörduvad tagasi kliendi juurde ja testivad kõiki valdkondi, mis esialgses auditis läbi kukkusid. Audiitorid testivad uut teavet uuesti, tagamaks, et klient muutis varasemate vigade parandamiseks raamatupidamistavasid. Tavaliselt järgneb parandusaudit. sama – ehkki vähem intensiivse – metoodika.