Nagu kõigil sportlikel tegevustel, on ka pesapallil oma spordispetsiifilised konditsioneerimismeetodid. Seal on palju harjutusi, mis on kasulikud kõigile mängijatele ja teised harjutused on mõeldud kindlatel positsioonidel olevatele mängijatele. Mõned näited on harjutused üldise füüsilise vormi parandamiseks, harjutused, mis suurendavad vastupidavust ja jõudu mängija viskekäes ning harjutused, mis parandavad sportlase käe-silma koordinatsiooni. Pesapalli konditsioneerimine varieerub sõltuvalt inimese vanusest, oskuste tasemest ja eesmärkidest, kuid treenimine on tavaline, et aidata sportlasel valmistuda ja säilitada tulemuslikkust kogu hooaja vältel.
Pesapalli konditsioneerimine hõlmab mitmesuguseid harjutusi, mille eesmärk on parandada kehalist vormi ja võimeid. Kuigi treenimine hõlmab jooksuharjutusi, mis on mõeldud vastupidavuse suurendamiseks ja jalaharjutusi, mille eesmärk on parandada osavust, püüavad pesapallitreeningu enim praktiseeritud vormid sageli parandada käte konditsioone ja käe-silma koordinatsiooni. Olenemata tema positsioonist teemandil, saavad sellisest treeningust kasu kõik pesapallurid.
Enamasti on viskajatel kõige rangem pesapalli konditsioneerimisrežiim; nad alustavad tavaliselt hooaja treenimist enne teisi mängijaid ja hooaja jooksul jätkuvad nende treeningud üldiselt intensiivsemal tasemel kui enamiku positsioonimängijate oma. Kannatreeningud on mõeldud käte vastupidavuse ja viskemehaanika parandamiseks, et käsi suudaks säilitada pidevat ja korduvat liikumist kõrgel tasemel, vältides samas vigastusi. Lisaks hõlmab viskajate treenimine üldiselt jõu parandamist, mille eesmärk on parandada väljakute kiirust, samuti harjutusi randmejõu saavutamiseks, mida on vaja tõhusate kiirusväliste väljakute jaoks, nagu näiteks kurvipallid või vahetused. Nagu teised mängijad, töötavad ka viskajad jalgade töö ja paindlikkuse nimel, et oma positsiooni õigesti ja kiiresti välja panna.
Käe-silma koordinatsioonitreening on pesapalli treenimise põhikomponent, sest selliseid oskusi vajavad kõik mängijad. Mõnel sportlasel on kõrge loomulik käe-silma koordinatsioon, kuid seda saab veelgi parandada ja arendada. Käe-silma koordinatsiooniharjutused hõlmavad löömisharjutusi, püüdmisharjutusi ja arvutisimuleeritud mooduleid, mis võimaldavad lööjatel jälgida vastaste viskajate käte liikumist. Käe-silma koordinatsioonitreening ei paranda mitte ainult võimet lüüa väljakuid löögitsooni erinevates kohtades, vaid see on oluline ka väli- ja siseväljakumängijate jaoks optimaalse positsioneerimise jaoks, kui nad valmistuvad vastutuleva palli välja andma.
Pesapalli konditsioneerimise kaalumisel tuleks silmas pidada võistlustaset ja sportlase vanust. Vigastust võib saada ka siis, kui mõne spordiala jaoks ei treenita korralikult, kuid vigastada võib ka tingituna. see kehtib eriti laste ja teismeliste kohta. Lapsevanematel ja treeneritel soovitatakse kuulata oma lapsi ja mängijaid, kes kurdavad küünarnukkide, käte, selja või kaela valulikkuse üle, mis võib olla põhjustatud liiga rangest konditsioneerimisest.