Vaimne tee Siddha jooga põhineb sisuliselt filosoofial, et sisemisele minale keskendumine võib tuua inimese Jumalale lähemale. See lähtub suuresti Kashmiri šivismist ja Vedanta Hindu vaimsetest traditsioonidest. Selle praktiseerijad esitlevad siddha joogat kui individuaalset vaimsust, mida sageli arendatakse usukaaslaste kogukonnas. Olenevalt individuaalsest ettekujutusest organisatsiooni kohta nimetatakse seda tavaliselt kas uueks usuliikumiseks või kultuseks.
Siddha jooga on kombinatsioon igapäevasest praktikast ja õpetustest, mille annab edasi guru. Õpetused hõlmavad eneseavastamise, teiste teenimise ja hinduistliku religiooni pühakirjatraditsioonide järgimise põhifilosoofiat. Praktika hõlmab mediteerimist, laulmist ja vaimuliku muusika kuulamist. Neid tegevusi tehakse tavaliselt meditatsioonikeskustes ja retriitidel, kuigi mõnda igapäevast tegevust saab harjutada ka kodus.
Siddha joogaga uus õpilane saab tavaliselt vaimse initsiatsiooni shaktipat dikshana tuntud praktikaga. See on protsess, mille käigus guru tervitab valmis õpilast sümboolse žestiga, nagu puudutus, mantra või püha sõna. Sel viisil arvatakse, et guru on tunginud ja sisenenud õpilase vaimu. Mõned meetodi järgijad on kirjeldanud seda protsessi kui guru aurat, mis ümbritseb õpilast.
Swami Muktananda Paramahamsa asutas Siddha jooga Indias oma vaimse õpetaja Bhagawan Nityananda juhendamisel. Lõpuks avas ta mitu meditatsioonikeskust üle kogu maailma. Keskused on olnud Jaapanis, Ameerika Ühendriikides, Suurbritannias, Austraalias ja Prantsusmaal ning paljudes teistes riikides. Liikumine on kaldunud keskenduma suurimatele ashramidele New Yorgis ja Ganeshpuris Indias. Pärast Swami Muktananda surma 1982. aastal võttis Siddha jooga liikumise vaimse juhtimise üle tema jünger Gurumavi Chidvilasanada, kes oli algselt tuntud kui Malti Shetty.
Mõnede Siddha jooga gurude tegevuse ja liikumise üle on olnud vaidlusi. William Rodarmor 1983. aastal ja Lis Harris 1994. aastal tekitasid mitmes avaldatud artiklis selle praktika suhtes kahtlusi. Alates 1996. aastast on veebisait Leaving Siddha Yoga säilitanud ka liikumise ja selle juhtide suhtes väga kriitilise hääle. Süüdistused liikumise vastu on hõlmanud seksuaalset kuritarvitamist, meelekontrolli ning häirivat ja sobimatut sisetüli gurude ja nende kaaslaste vahel. Samuti on liikumisest olnud peamiselt positiivseid profiile mitmete populaarsete ajakirjade artiklites.