Nii nagu automootorid vajavad regulaarsete ajavahemike järel hooldust ja remonti, vajavad ka paadimootorid. Paadimootori remonti saab sageli teha kodus põhiliste tööriistadega, samas kui muud remonditööd võivad olla põhjalikumad. Kui paadimootori remont, mida tuleb teha, on põhjalik remont, on hea mõte osta selle konkreetse mootori juhend. See võimaldab remontijal saada samm-sammult juhiseid tavaliste remonditööde tegemiseks ning samuti on hea viis osade tuvastamiseks, kui need ümber paigutatakse või kaotsi lähevad.
Püüdke vabastada ruumi paadimootori remonditöödeks. See ruum peaks olema puhas ja avar ning võimaluse korral sisaldama töölauda. Kui mootorist on vaja osi eemaldada, on oluline need paigutada väljavõtmise järjekorras. See muudab kokkupaneku palju lihtsamaks ja hoiab ära osade vales orientatsioonis uuesti kinnitamise. Puhastage kõik osad korralikult, vajadusel määrige uuesti ja kontrollige enne uuesti paigaldamist kõiki osi kahjustuste suhtes. Kui mootorit ei eemaldata paadist, puhastage kindlasti paadi enda pind tööruumina. Tööruum peaks olema puhas ja korrastatud.
Enne protsessi alustamist võtke kindlasti kaasa kõik paadimootori remondiks vajalikud tööriistad. Mootori juurest eemaldumine, et tööriistu osta või laenata, võib panna remonditöökoja protsessi sammud unustama või remondi käigus vigu tegema. Ostke ka mis tahes õli, bensiin, määrdeained jne, mis on remondi ajal vajalikud, et kõik osad saaksid vajalikke aineid.
Nagu automootorid, kuluvad ka paadimootorite osad. Kontrollige tootja hooldusgraafikutest, millal tuleb tavalised osad välja vahetada. Paljud paadimootorite remonditööd tehakse siis, kui tavalised osad ebaõnnestuvad, mistõttu võib tootja soovitada need osad välja vahetada, enne kui need ebaõnnestuvad ja põhjustavad rohkem probleeme. Tihendid, termostaadid, pumbad ja nii edasi võivad teel probleeme tekitada, seega vahetage need vajaduse korral välja ettenähtud aegadel.
Enne remondi alustamist tuleb mootor niiskusest puhtaks loputada. Tegelikult soovitavad paljud tootjad mootorit pärast iga kasutamist loputada, et vältida korrosiooni ja mootori osade kogunemist. See loputamine võib pikendada osade eluiga ja vältida kahjustusi pikemas perspektiivis. Loputamine enne paadimootori remondi alustamist tagab, et niiskus ei kahjusta teisi osi.