Paadimootoreid on kolme põhitüüpi: kahe- ja neljataktilised päramootorid, sisemine gaas- ja diiselmootorid. Erinevat tüüpi paadimootorite remonditööd sõltuvad fikseeritava mootori tüübist. Mootori jagamine alamsüsteemideks, nagu jahutus, kütus, käigukast ja mootor, võib aidata teavitada vajalikest remonditöödest.
Jahutussüsteemid on sisuliselt pumbad, mis tsirkuleerivad vett või jahutusvedelikku läbi mootori. Pumpadel on tiivikud ja tihendid, mis lõpuks vajavad väljavahetamist ja parandamist. Mõned tiivikud on kummist ja mõned pronksist ning igaüks nõuab erinevat tüüpi hooldust. Olenevalt paadimootori tüübist võivad tihendid varieeruda huuletüüpi tihenditest kaheosaliste mehaaniliste tihenditeni. Mehaaniline tüüp on töömahukam asendada.
Erinevat tüüpi mootorite kütusesüsteemid erinevad karburatsioonist kuni kütuse sissepritseni, kuid kõigil on nii primaarsed kui ka sekundaarsed filtrid, mis vajavad aeg-ajalt väljavahetamist ja parandamist. Kütusefiltri vahetamine on tavaline hooldusprotseduur, olenemata mootori tüübist. Karburaatorid vajavad aeg-ajalt puhastamist ja häälestamist ning ka kütusepihusteid tuleb perioodiliselt puhastada, katsetada ja välja vahetada. Samuti tuleb katsetada ja vajadusel välja vahetada sissepritsepumbad, mis erinevad kütusepihustitest.
Käigukastid on paadimootorite remondi tavaline element. Sellised korpused on üsna erineva tüübi ja suurusega, ulatudes vaid mõnest naelast tuhandete naelani, kuid kõik nõuavad siduri hooldust. Erinevat tüüpi sidurid nõuavad erinevat remonti. Kõik vajavad aeg-ajalt reguleerimist või väljavahetamist. Käigukastides on ka õlisse sukeldatud hammasrattad ja õli tuleb regulaarselt vahetada. Käigukasti õli vahetamata jätmine võib kaasa tuua paadi mootori suurema remondi, mis on tõenäoliselt üsna kulukas.
Paadimootorid on kolbmootorid, mis nõuavad regulaarselt õli ja filtrite vahetamist. Mootoril endal on kolvid, rõngad ja laagrid, mis kõik kuluvad ja vajavad väljavahetamist. Kui mootor ei tööta korralikult, saab teha survetesti, et teha kindlaks, kas probleem on rõngastes, ventiilides, kolvides või silindripeas. Kompressioonitestid tehakse igat tüüpi mootoritele. Ajastuse kontrollimine on veel üks protseduur, mida tehakse kõigil mootoritel. Kompressioonitestide läbiviimine ja ajastuse kontrollimine on protseduurid, mis aitavad mehaanikutel kindlaks teha, millist paadimootorit on vaja remontida.