Nii alus- kui ka rakendusuuringud on inimteadmiste edendamiseks olulised, kuid need toimivad veidi erineval viisil ja neil on erinevad lõppeesmärgid. Alus- või puhasuuringud viiakse läbi üksnes teabe kogumise ja olemasolevate teadmiste edasiarendamise eesmärgil, erinevalt rakendusuuringutest, mis on suunatud konkreetse küsimuse lahendamisele. Neuroloog, kes uurib aju, et saada teada selle üldisest toimimisest, teeb alusuuringuid, samas kui neuroloog, kes otsib Alzheimeri tõve päritolu, tegeleb rakendusuuringutega.
Sageli toetuvad rakendusuuringud olemasolevatele alusuuringutele. Alusuuringuid võiks pidada teadmiste aluseks, mis annavad inimestele põhiteavet, mida nad vajavad teatud uurimisvaldkondadega tegelemiseks. Näiteks kahe ülaltoodud neuroloogi näitel kasutab neuroloogilise seisundi rakendusuuringutega tegelev neuroloog tõenäoliselt aju üldisemalt uuriva neuroloogi avaldatud uuringuid.
Piirid alus- ja rakendusuuringute vahel võivad hägustuda. Näiteks võib akude ja energia salvestamise meetoditega ringi mängiv teadlane kogemata komistada revolutsioonilise aku otsa, mida saaks kasutada kaubandusliku tootena. Sel juhul võib energia mõistmise ja salvestamise viiside üldisemaks väljatöötamiseks tehtud uuringutel olla vahetu reaalne rakendus, näiteks maja päikesepaneelide lõksus oleva päikeseenergia salvestamine.
Alusuuringutes uuritakse ja testitakse üldisi teooriaid, ideid ja küsimusi, alates sellest, kust universum pärineb, kuni loomade suhtlemiseni. Mõned inimesed on väitnud, et seda tüüpi teadusuuringud ei tohiks olla prioriteetsed, sest see ei too alati inimestele otsest kasu, kuid ilma alusuuringuteta oleks paljudel rakendusuuringute programmidel raske alustada. Alusuuringute tegemine tagab, et rakendusteadlastel ei pea iga kord uut projekti alustades jalgratast leiutama, sest eeltöö on tehtud.
Mõned teadlased eelistavad keskenduda ühte või teist tüüpi uurimistööle, käsitledes loomulikku uudishimu või muret inimeste konkreetsete probleemide pärast. Teised võivad lennata edasi-tagasi või avastada, et nad alustavad projekti, mida võiks pidada lihtsaks ja mida saab rakendada, või vastupidi. Paindlikkus teadusuuringutes on ülioluline, kuna see edendab innovatsiooni ja uusi lähenemisviise teadusprobleemidele. Alusuuringuid kritiseeritakse mõnikord kui rahastamisvitsat, kuid tegelikult võivad mõlemad uurimistüübid olla kulukad ja alusuuringutesse investeerimine säästab pikas perspektiivis raha, edendades üldteadmiste uurimist.
SmartAsset.