Hambaharju kasutatakse tavaliselt hammaste ja suu puhastamiseks. Selle käigus täituvad need sageli bakterite ja muude mikroobidega, mis võivad aja jooksul paljuneda. Hambaharja puhastusvahendit saab kasutada kahjulikest mikroorganismidest vabanemiseks enne, kui need uuesti inimkehasse sisenevad. Suhteliselt lihtsates seadmetes on sageli bakterite hävitamiseks keemiline aur või aur, samas kui keerulisemad versioonid sisaldavad ultraviolettvalgusallikat (UV) mikroskoopiliste organismide hävitamiseks. Hambaharjade puhastusvahendeid on erinevat tüüpi ja need võivad aidata vältida külmetushaiguste, gripi ja muude haiguste levikut.
Hambaharja puhastusvahend võib koosneda ultraviolettvalgusega hoidmissüsteemist, mida haiglad ja hambaarstid sageli instrumentide steriliseerimiseks kasutavad. Hambaharjade puhastussüsteemid võivad töötada mõne minutiga, et tappa baktereid, viirusi ja hallitust. Need potentsiaalselt ohtlikud asjad kogunevad sageli vannituppa, kuna keskkond on soe ja niiske. Hambahari desinfitseerimisvahend võib olla umbes sama suur kui hoidik, et see sobiks tavalisele vannitoaletile või seinale. Mõnikord on saadaval akutoitega ja elektrilised versioonid ning mõnel seadmel on põhi, mis ei libise märjalt tööpinnalt maha.
Mõned UV-hambaharja puhastusvahendid võivad kesta tuhandeid tunde ja hoiavad harju isegi väljalülitatuna. Tihti mahub nendesse ka mitu hambaharja, nii et terve pere saab kasutada ühte seadet. Väiksemad variatsioonid võivad sisaldada keemilisi auru, mis tapab mikroorganisme. Kemikaalide jäägid, mis mõnikord sellisesse hambaharjapuhastusvahendisse jäävad, võivad suhu sattudes põhjustada terviseprobleeme. Samuti on puhastusvahendeid, mis kasutavad auru või kuumust, mis võivad tõhusalt hävitada mikroobe ja on üldiselt ohutumad.
Paljud hambaharjapuhastusvahendite mudelid suudavad desinfitseerida ühe harja ja mõned versioonid on piisavalt suured, et mahutada paar neist. Mõned tüübid on ehitatud paigal püsima, kuid mõned reisikomplektid kasutavad UV-valgust, hoolimata sellest, et need on täissuuruses versioonidest väiksemad. Need võivad hambaharjad mõne minutiga puhastada, kui inimesed ööbivad hotellis või reisivad näiteks lennukiga.
Lastele mõeldud hambaharjapuhastusvahendid on sageli saadaval eraldi sortidena. Nad võivad esineda populaarsete koomiksitegelaste, piraatide ja koletiste kujul, kuid täita sama puhastusülesannet. Õige kasutamise korral võib hambaharja puhastusvahend eemaldada hambaharja harjastest mikroobe ning lisaks igeme- ja suuhaigustele hoiab see sageli ära ka gripi, külmetuse.