Põllumajandustootjad kaotavad igal aastal tohutul hulgal saaki erinevate põllukultuuride haiguste tõttu. Et mõista, kuidas ja miks teatud haigused teatud põllukultuure tabavad, on taimepatoloogid liigitanud kõik haigused kahte üldrühma, nakkuslikud ja mittenakkuslikud. Kui haigusi on jagatud ühte kategooriasse, kirjeldatakse neid patogeeni tunnuste või keskkonnapõhjuste, näiteks seente, bakterite, äärmuslike temperatuuride või mullapuuduse järgi. Lõpuks klassifitseerivad aiandusspetsialistid haigusi selle mõjutatud põllukultuuri osa järgi, nagu lehehaigused, juurehaigused ja palju muud. Põllukultuuride haigusi on palju, kuid põhiliselt kuuluvad kõik haigused edasiseks klassifitseerimiseks nakkuslike ja mittenakkuslike haiguste kategooriasse.
Mittenakkuslikud ehk abiootilised haigused on need, mis on põhjustatud ebasoodsatest keskkonnatingimustest ja mis ei tulene elusorganismidest. Üldjuhul kipuvad mittenakkushaigused taime nõrgestama, muutes taime vastuvõtlikuks raskematele nakkushaigustele. Mittenakkushaiguste näideteks on äärmuslikud temperatuurid, liigne või veepuudus, putukad, mulla halb toiteväärtus ja mürgised kemikaalid. Need tegurid võivad nõrgestada kogu taime või teatud taimeosa, muutes taime vastuvõtlikuks tüve nakkushaigustele, seemnehaigustele, kaunahaigustele ja muule.
Nakkushaigused ehk biootilised haigused moodustavad suurema osa erinevatest põllukultuuride haigustest. Neid põhjustavad elusorganismid, mis nakatavad saaki. Põllukultuuride haigusi põhjustavad kõige levinumad seened, nagu rämps, rooste, hallitus ja lehemädanik. Enamik seeni vajab arendamiseks ja paljunemiseks väga niiskeid tingimusi. Mõnel seenel tekivad põllukultuuridele mädavillid, teised aga pulbrilise, värvunud tahma kolooniat.
Bakterid ja viirused, mis on teised nakkusohtlikud peremehed, on väikesed organismid, mis imbuvad taimeorganitesse ja paljunevad. Mõned bakterid ei kahjusta põllukultuure, kuid teised võivad toota toksiine või rünnata taimede rakke toidu saamiseks. Viirused levivad tavaliselt putukate kaudu, kui putukas närib läbi taime kaitsva väliskihi ja imbub siserakkudesse. Bakteriaalne lehemädanik ja närbumine kimbutavad sageli nisu- ja odrakultuure ning köögivilju, nagu kurgid ja oad. Viiruste põhjustatud põllukultuuride haigused võivad põhjustada märkimisväärset kahju, näiteks nisutriibu mosaiikviirus ja kartuliviiruse haigused, mis võivad kogu saagi väga kiiresti hävitada.
Nakkushaigusteks liigitatakse ka nematoodid ja algloomad. Need pisikesed ussilaadsed organismid elavad mullas, oodates võimalust rünnata mittenakkuslike põhjuste tõttu nõrgestatud saaki. Nad võivad kanda viiruseid, põhjustades põllukultuuridele täiendavat kahju ja raskendades haiguste ravi. Nende biootiliste haiguste näideteks on kartuli-nematood, männi närbumine ja sojaoa tsüst. Nagu nende nimedest selgub, tungivad need põllukultuuride haigused põllukultuuride tundlikku juur- või veresoonkonda ja põhjustavad tsüste, mis pärsivad taimede kasvu ja vähendavad järsult saagikust.
Põllukultuuride haiguste ohjeldamine või ravimine on suur äri. Teadlased ja põllumehed on põllukultuuride haiguste tõrjeks välja töötanud hulgaliselt fungitsiide, insektitsiide, pestitsiide ja antibakteriaalseid lahuseid. Kuigi edusamme on tehtud, on patogeenid näidanud visalt kalduvust repellentidega kohaneda. Kuna põllumajandussektor saab rohkem teada põllukultuuride haiguste eri tüüpide ja põhjuste kohta, muutub see paremini varustatud paljude maailma põllukultuure vaevavate haiguste ravimiseks ja ennetamiseks.