Inimestel on reproduktiivsüsteemi füsioloogia meeste ja naiste vahel erinev. Mõlemal sugupoolel moodustavad reproduktiivsüsteemi füsioloogia välis- ja sisesuguelundid ning sugunäärmed, kuid see, mis ja kus need organid asuvad, erineb oluliselt. Suguelundid on elundid ja kehaosad, mida on vaja paljunemiseks. Sugunäärmed on elundid, mis vastutavad sugurakkude ehk sugurakkude tootmise eest.
Meeste reproduktiivsüsteemi füsioloogia hõlmab mitmeid kehaosi ja organeid. Välissuguelundid koosnevad peenisest ja munandikottist. Sisemised suguelundid asuvad enamasti nendes meeste kehaosades ja hõlmavad munandeid, munandimanust, vasdefereneid, seemnepõiekesi, kusiti ja eesnääret. Isassugurakud ehk spermatosoidid toodetakse munandites, mis on meeste sugunäärmed.
Kui enamik isaste suguelundeid leidub välissuguelundites, siis naiste puhul see nii ei ole. Naiste reproduktiivsüsteemi füsioloogia paikneb enamasti alakõhus. Välissuguelundid koosnevad häbememokkadest ja kliitorist, mis on seksuaalseks stimulatsiooniks tugevasti enerveeritud. Enamik elundeid on siseorganid ja nende hulka kuuluvad tupp, emakakael, emakas, munajuhad ja munasarjad. Munarakud ehk munad tekivad emaste munasarjades.
Isastel ja naistel ei erine mitte ainult reproduktiivsüsteemi füsioloogia, vaid ka protsess, mille käigus sugurakud tekivad ja toimetatakse paljunemise ajal. Spermatogenees on protsess, mille käigus toodetakse spermat munandite seemnetorukestes, mis jätkub kogu mehe eluea jooksul. Kui sperma rakud on toodetud, küpsevad need ja säilitatakse munandimanuses, et valmistuda viljastamiseks. Enne ejakulatsiooni segatakse sperma moodustamiseks seemnerakud eesnäärme ja seemnepõiekese seemnevedelikuga. Ejakulatsiooni ajal väljub sperma peenisest kusiti kaudu.
Emasloomadel on kõik munarakud olemas alates sünnihetkest ja kogu naise eluea jooksul enam munarakke ei toodeta. Puberteedieast alates hakkavad munarakud munasarjades küpsema ja iga kuu vabaneb ühest munasarjast üks küps munarakk. See vaheldub nende kahe vahel. Seejärel liigub see mööda munajuha emakasse. Kui seemnerakuga viljastumist ei toimu, väljutatakse menstruatsiooni ajal munarakk ja emaka limaskesta emakakaela ja tupe kaudu.