Reproduktiivsüsteemi anatoomia hõlmab neid organeid, kudesid ja veresooni, mis osalevad paljunemisprotsessis või ühe või mitme järglase genereerimises isas- ja naisvanemast. Erinevalt teistest inimkeha süsteemidest erineb reproduktiivsüsteemi anatoomia meestel ja naistel oluliselt. Naistel on peamised elundid tupp, emakas ja munasarjad, meestel aga peenis, munandikott ja munandid. Munajuhad ja emakakael ühendavad neid organeid naiste reproduktiivsüsteemis, samas kui meestel hõlmavad veresooned munandimanust ja vasdefereneid. Arutelu reproduktiivsüsteemi anatoomia üle peab hõlmama ka selle väikseimaid üksusi, meestel spermarakku ja naistel munarakku või munarakku.
Nii meestel kui naistel võib reproduktiivsüsteemi anatoomia jagada välis- ja siseorganiteks. Naiste välist organit nimetatakse sageli tupeks. See organ on aga tehniliselt sisemine kanal, mis juhib meeste sperma emakasse.
Naiste välised suguelundid hõlmavad kaitsev häbememokad, suured voldid, mis ümbritsevad ülejäänud välisorganeid: väikesed häbememokad, kliitor ja Bartholini näärmed. Väikesed häbememokad on väiksemad voldid, mis kaitsevad nii tupe kui ka ureetra ehk kuseteede ava. Kliitor on tupeava ees asuv väike närvidega täidetud organ, mis on homoloogne mehe peenisega. Naistel on ka Bartholini näärmed, mis vabastavad eritist, mis annab peenise esialgse määrimise tuppe sisenemisel.
Meeste reproduktiivsüsteemi välisorganite hulka kuuluvad peenis, munandid ja munandikott. Peenis on elund, mis võimaldab spermal jõuda vahekorra või tupe kaudu emase munarakku. Tihe veresoontega, muutub see erutuse ajal püsti, kuna piirkonda voolab kiirelt verevool, võimaldades tal tungida läbi naise tupe. Peenise taga on munandikott, väline kott, mis sisaldab ja kaitseb paarismunandeid. Need munandid või munandid on elundid, mis toodavad spermat, meeste sugurakke.
Reproduktiivsüsteemi anatoomia peab hõlmama ka sisemisi paljunemisorganeid. Naistel on need vagiina, emakas ja munasarjad. Vagiina on laienev, vaid mõne tolli sügavune kanal, mis viib emakasse ja mille kaudu laps sünnituse ajal läbib. Vagiina tagaosas on emakakael, ava, mille kaudu sperma liigub teel emakasse. Emakas on ruum, kus loode raseduse ajal kasvab, ja see võib ka palju laieneda.
Emaka ülaosa mõlemal küljel viivad munajuhad munasarjadesse, naissuguorganitesse. Need elundid toodavad munarakke või mune, mis vabanevad iga kuu, et meessoost sperma saaks neid viljastada. Kui seda ei juhtu, väljutatakse need kehast koos emaka limaskestaga, kuhu viljastatud munarakk end viljastudes imbub, menstruatsiooni näol.
Meeste reproduktiivsüsteemi sisemine anatoomia hõlmab ureetrat, vase deferensit ja munandimanust. Alates peenise otsas olevast avast on ureetra sisemine anum, mis juhib kehast välja spermat, spermat sisaldavat vedelikku ja uriini. See viib vas deferensi, torusse, mis viib sperma kusiti.
Epididüüs on munandite säilitusüksus. See asub iga munandi taga ja on toru, milles asuvad munandite toodetud seemnerakud, kuni need on emase muna viljastamiseks piisavalt küpsed. Ergutuse ajal vabanevad need rakud munandimanusest vas deferensi, kus nad segunevad seemnevedelikuga, moodustades spermat, mis ejakulatsiooni ajal eraldub naise tuppe.