Endokriinsüsteem ja homöostaas on omavahel seotud eelkõige selle poolest, et teatud tasakaalustamatuse põhjuseid saab parandada endokriinse sekkumisega. Homöostaasi võib käsitleda kui süsteemi tasakaalustatud olekut. See võib viidata mis tahes süsteemile või kehtida elusolendi kohta, nagu füsioloogia puhul. Püsiseisund, sarnane termin, erineb homöostaasist selle poolest, et see viitab tasakaalule, mis on tõusnud algtasemest kõrgemale, samas kui homostaas on tasakaal algtasemel. Kui homöostaas viiakse sisemiste või väliste meetmetega tasakaalust välja, peab keha selle seisundi taastamiseks tegutsema. Kui tasakaalustamatuse süüdlane on olemuselt hormonaalne, siis on endokriinsüsteem ja homöostaas omavahel tihedalt seotud.
Peaaegu iga terve keha füsioloogiline toiming aitab säilitada homöostaasi. On pidev ja lõputu hulk stressoreid, mis üritavad keha tasakaalust välja viia. Trepist üles kõndimine nõuab energiat, mis paneb keha südame-veresoonkonna ja lihaste süsteemid rohkem tööle, nõudes kõrgendatud seisundit. Seejärel peab keha selle vastu võitlema, leides viise, kuidas end algtasemele tagasi viia.
Endokriinsüsteem on näärmete või hormoone vabastavate struktuuride kogum, mis toimib nende reguleerivate kemikaalide otse vereringesse süstimiseks. Seda ei tohi segi ajada sarnase eksokriinsüsteemiga, mis kasutab hormonaalsete muutuste esilekutsumiseks kanaleid ega ole otsene tee vereringesse. Ringlusesse sattudes liiguvad need hormoonid keha erinevatesse organitesse ja kui nende konkreetsed sihtretseptorid on olemas, põhjustavad nad sündmuste ahela, mis lõppeb soovitud füsioloogilise toimega.
Kui näiteks süda lööb ilma füsioloogilise vajaduseta liiga kiiresti, on endokriinsüsteem ja homöostaas seotud sellega, et hormoon võib südametegevust aeglustada. Seda hormooni võib konkreetne nääre vabastada otse vereringesse ja ringleda mitmetesse organitesse. Igal hormoonil on aga konkreetne retseptor ja kui see retseptor puudub, ei avaldata mõju. Seetõttu mõjutab hormooni vabanemine ainult neid organeid, mis on suunatud hormonaalsele sekkumisele.
Kokkuvõttes on endokriinsüsteem ja homöostaas seotud selle poolest, et koos võimaldavad igapäevast toimimist. Ilma hormonaalse sekkumiseta ei oleks inimkehal paljudel juhtudel võimalust oma ainevahetust tasakaalu jaoks vajalikul viisil muuta. Sel põhjusel on endokriinsüsteem füsioloogilise regulatsiooni väga oluline osa.