Enamikul juhtudel on toidu lisaainetel kolm eesmärki: säilitada, parandada maitset või muuta toidu välimust. Kuigi enamikku peetakse inimtoiduks ohutuks, on mõningaid toidu lisaaineid, mida võimalusel vältida. Teatud neist võivad põhjustada kõrvaltoimeid nende ainete, eriti toiduvärvide ja naatriumglutamaadi (tuntud ka kui MSG) suhtes tundlikel inimestel. Teised, nagu transrasvad ja kõrge fruktoosisisaldusega maisisiirup (HFCS), võivad avaldada negatiivset mõju kolesteroolile ja põhjustada kehakaalu tõusu.
Toiduvärve leidub valdavas enamuses pakendatud toiduainetes, eriti maitsestatud kartulikrõpsudes ja kommides. Teatud inimestel on loomulik eelsoodumus allergiliste reaktsioonide tekkeks nende toidulisandite, eriti FD&C kollase nr 5 suhtes, mis võib põhjustada väikesel hulgal inimestel nõgestõbi. Muud toidulisandid, mida tuleks vältida, on sinine nr 1, sinine nr 2 ja kollane nr 6, mis on Norras keelatud kromosoomikahjustuste suurenenud riski ja laboriloomadel tehtud katsete käigus avastatud kasvajate tekke tõttu.
MSG, mis on tavaline maitset parandav toidulisand konservides ja mõnes Hiina köögis, võib selle suhtes tundlikel inimestel põhjustada reaktsiooni, mida nimetatakse MSG sümptomite kompleksiks. See reaktsioon võib põhjustada turset, näo või kaela tundlikkuse kaotust, südamepekslemist ja kõhuprobleeme. Kuigi need sümptomid on tavaliselt ajutised, võivad need olla tundlikele inimestele äärmiselt ebamugavad ja harvadel juhtudel ajutiselt kurnavad, mistõttu on see üks paljudest toidulisanditest, mida tuleb vältida.
Transrasvu, mida tavaliselt kasutatakse toidu säilivusaja pikendamiseks või selle maitse parandamiseks, peetakse üheks peamiseks toidulisandiks, mida tuleks vältida, ja need on paljudes erinevates riikides, sealhulgas Taanis, tõhusalt keelatud. Transrasvade, mida leidub kõige sagedamini kiirtoidus, pakendatud küpsistes ja saiades, ning või asendaja margariini tarbimist on seostatud halva kolesterooli taseme tõusuga ja hea kolesterooli taseme langusega. Selline reaktsioonide kombinatsioon võib suurendada inimese südameinfarkti või insuldi riski ning olla osaliselt vastutav diabeedi tekke eest.
HFCS-i kasutamine pakendatud toitudes ja jookides on väga vastuoluline, hoolimata asjaolust, et 2011. aasta seisuga ei ole uuringud lõplikud. HFCS-i on seostatud kaalutõusuga, kuigi pole selge, kas see põhjustab rohkem kaalutõusu kui tavaline suhkur. Üldiselt on HFCS-i probleem selles, et seda leidub enamikus pakendatud toitudes, isegi neis, mis ei ole mõeldud magusaks. Sel põhjusel tarbivad töödeldud toidu sööjad tavaliselt suuremas koguses HFCS-i, kui see on tervislik, ilma seda teadvustamata. Sel põhjusel peetakse seda kunstlikku magusainet üheks toidu lisaaineks, mida tuleb vältida või piirata, kuna tavaliselt soovitatakse enamikul inimestel mitte tarbida liigset suhkrut või suhkruasendajaid.