Mesilaste eemaldamiseks saab kasutada mitut meetodit. Oluline on kontrollida, kas nakatunud on tõepoolest mesilased, mitte herilased või muud putukad, kuna kasutatavad tehnikad on olenevalt liigist erinevad. Kui kahjurite identiteet on ebaselge, võib hävitaja olla võimeline putukad tuvastama ja andma asjakohaseid eemaldamisnõuandeid. Entomoloogid võivad pakkuda ka tuvastamist ja nõu; ülikoolide laiendused on sageli heaks abivahendiks entomoloogile, kes suudab putukaid tuvastada.
Mesilaste eemaldamise puhul on inimestel kaks põhilist võimalust. Üks on humaanne mesilaste eemaldamine, mille käigus mesilased eemaldatakse ja paigutatakse ümber. Teine on mesilaste hävitamine. Hävitamist üldiselt ei soovitata, kuna mesilased on kasulikud putukad ja hävitamine pole tavaliselt lihtsam kui eemaldamine.
Mesilaste humaanseks eemaldamiseks on parim eemaldamisega tegeleja mesinik. Seda teenust osutavad ka kahjuritõrjefirmad. Sageli tehakse seda õhtul, kui mesilased on loid, ja see hõlmab mesilaste ja nende mesilasemade teisaldamist kasti ning seejärel taru eemaldamist. Taru, sealhulgas kogu mesilasvaha ja mee eemaldamine on oluline, sest vastasel juhul võivad kahjurid piirkonda meelitada. Püsivad mesilaste feromoonid võivad meelitada ka uusi mesilasi.
Mesilased viiakse uude kohta ja seatakse üles koos taruga. Tavaliselt asuvad nad hästi sisse ja kui nad seda ei tee, võib ellujäänuid kombineerida teiste tarudega. Mesilased tegutsevad oma kooslustes tolmeldajatena ja toodavad mett, millel võib olla mesiniku jaoks kaubanduslikku väärtust.
Kui mesilaste eemaldamiseks palgatakse hävitaja või inimesed otsustavad mesilased ise eemaldada, tappes need, võib putukate hävitamiseks kasutada pihusid. Mesilasi ja nende taru ei saa siiski paigale jätta. Taru tuleb eemaldada ja ala tuleb põhjalikult puhastada, et eemaldada kahjurite atraktandid, näiteks mesi, mis võivad sipelgaid sisse tõmmata. Samuti on oluline taru õigesti utiliseerida.
Iga mesilaste eemaldamise meetod nõuab küünarnuki määret, et puhastada pesa hõivatud ala, nii et pesa uuesti koloniseerimine on väiksem. Samuti on hea mõte pärast mesilaste ja nende taru täielikku eemaldamist ala pitseerida, et putukate tagasipöördumine oleks raskendatud.