Esimene samm parimate aiapuude valimisel on otsustada, milliseid omadusi soovite puudel omada. Näiteks kui teie eesmärk on kasvatada puid, mis kiiresti valmivad, on hea valik kiiresti kasvavad liigid, nagu vaher, hübriidpapel või tulbipapp. Kui soovite istutada puid, et tagada privaatsus aastaringselt, loob igihaljaste taimede rida, nagu seeder või küpress, loomulikku kaitset. Järgmine samm parimate tagaaiapuude valimisel on otsustada, milline puu suurus sobib saadaolevasse ruumi. Soovite veenduda, et te ei istuta suurt puud kohta, mis nõuab sagedast pügamist, näiteks elektriliinide lähedusse.
Parimate tagaaiapuude valimine on oluline otsus, sest need puud on maastikul paljudeks aastateks olulised. Kui kaalute puid, mis pakuvad toiduallikat, on puuvilja- või pähklipuud suurepärane valik ning nende eeliseks on atraktiivsete õite ja varju pakkumine. Pähkli- ja viljapuid on saadaval nii kääbus- kui ka traditsiooniliste sortidena, nii et isegi väike tagaaed võib olla koduks ühele või mitmele neist toitu kandvatest puudest. Kui tagaaed on piisavalt suur, võite istutada isegi väikese viljapuuaia, kus on erinevaid vilja- ja pähklipuid.
Üks põhjus, miks paljud inimesed otsustavad koduaeda puid istutada, on varjuallikas. Soojas kliimas võib maja juures kasvav suur varjuline puu teda kuuma suvepäikese eest kaitsta ja konditsioneerimise kulusid vähendada. Võimalus istuda kuumal päeval varjulise puu jaheda ja haljendava võra all pikendab aega, mille jooksul inimesed saavad õues olemist nautida.
Kui soovite oma tagaaias näha suurt varjupuud, millel on laiutav võra, on tammed head valikud ja väga vastupidavad tagaaiapuud. Pin tammed on kiiresti kasvavad tammed, mille kõrgus on küpses eas 60–70 jalga (18–21 meetrit) ja mille laius on umbes 25 jalga (7.6 meetrit). Valged tammed seevastu kasvavad aeglaselt, kuid neil on suurem levimisharjumus, jõudes küpsusajal 100 jala (30 meetri) kõrguseks ja 50 jala (15 meetri) kõrguseks. Cottonwoods on ka kiiresti kasvavad varjupuud, mis võivad kasvada kuni 90 jala (27 meetri) kõrguseks ja 35 jala (10.6 meetri) võrastikuga.